130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2288 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  98.8 
 
 
333 aa  659    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  670    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  69.31 
 
 
312 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  59.93 
 
 
308 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  60.93 
 
 
412 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  54.13 
 
 
362 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  53.16 
 
 
328 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  53.29 
 
 
371 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  50.66 
 
 
373 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  44.78 
 
 
315 aa  278  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  49.34 
 
 
348 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  49.84 
 
 
342 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  50.83 
 
 
366 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  50.79 
 
 
417 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  51.19 
 
 
330 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  49.04 
 
 
341 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  49.83 
 
 
325 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  50.68 
 
 
325 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  48.49 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  46.96 
 
 
323 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  47.02 
 
 
326 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  49.16 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  45.82 
 
 
323 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  50.51 
 
 
327 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  47.9 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  46.62 
 
 
323 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  46.46 
 
 
348 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  45.45 
 
 
320 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  42 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  44.34 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  47.57 
 
 
324 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  47.57 
 
 
324 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  46.25 
 
 
336 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  45.87 
 
 
328 aa  231  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  46.6 
 
 
327 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  45.51 
 
 
326 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  46.69 
 
 
318 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  47.14 
 
 
325 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  46.28 
 
 
323 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  39.23 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  43.04 
 
 
334 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  45.25 
 
 
324 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  46.05 
 
 
325 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43.71 
 
 
326 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  46.76 
 
 
323 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  46.05 
 
 
325 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  46.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  45.57 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  45.22 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  43.55 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  45.57 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  43.95 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  44.94 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.52 
 
 
310 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.62 
 
 
334 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  44.08 
 
 
328 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  38.55 
 
 
334 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  44.62 
 
 
324 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  44.62 
 
 
324 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  43.88 
 
 
337 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  43.77 
 
 
337 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  43.88 
 
 
337 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  41.28 
 
 
329 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  36.74 
 
 
339 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  42.99 
 
 
337 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  41.51 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.75 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  39.8 
 
 
318 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  41.49 
 
 
337 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  41.49 
 
 
337 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  43.49 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  43.15 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  44.88 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  42.86 
 
 
723 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  42.35 
 
 
318 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  35.61 
 
 
337 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  42.72 
 
 
359 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  38.61 
 
 
766 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  35.52 
 
 
333 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  34.33 
 
 
344 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  34.33 
 
 
344 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  42.95 
 
 
320 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  41.18 
 
 
324 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  41.39 
 
 
321 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  42.36 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  40.86 
 
 
321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  40.86 
 
 
321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  40.86 
 
 
321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  41.03 
 
 
341 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  40.38 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  43.83 
 
 
324 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  41.2 
 
 
321 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  31.41 
 
 
339 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  43.39 
 
 
322 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  39.6 
 
 
321 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  33.11 
 
 
325 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  38.56 
 
 
321 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>