130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3037 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  100 
 
 		 323 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  57.48 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  54.72 
 
 		 323 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  54.4 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  58 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  56.07 
 
 		 723 aa  315  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  51.86 
 
 		 318 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  54.72 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  56.38 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  56.38 
 
 		 325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  52.61 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  56.71 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  53.14 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  51.01 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  49.54 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  51.96 
 
 		 323 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  55.63 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  52.88 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  49.35 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  48.99 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  50.98 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  52.01 
 
 		 326 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  53.74 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  50.68 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  52.32 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  50.68 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  50.34 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  48.31 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  48.32 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  50.34 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  48.97 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  46.86 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  50.65 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  49.38 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  49.5 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  48.59 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  48.28 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  48.28 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  46.78 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  46.85 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  44.73 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  49.06 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  49.06 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  50.32 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  50.32 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  46.86 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  46.86 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  50.32 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  45.7 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  45.17 
 
 		 412 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  44.71 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  45.76 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  41.4 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  45.73 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  46.76 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  46.76 
 
 		 333 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  43.34 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  43 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  45.27 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  43.15 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  45.31 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  42.62 
 
 		 315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  42.12 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  45.03 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  41.67 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  41.67 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  42.49 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  38.54 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  46.84 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  44.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  42.9 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  44.73 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  45.51 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  40.57 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  44.82 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  46.94 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  42.62 
 
 		 766 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  46.67 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  44.85 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  46 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  44.33 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  46.26 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  46.26 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  44.33 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  46.26 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  45.15 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  43.96 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  42.63 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  43.1 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  42.91 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  47.1 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  46.46 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  43.05 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  41.91 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>