131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4514 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  59.65 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  61.79 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  57.1 
 
 		 321 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  59.67 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  59.67 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  59.67 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  60.31 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  58.01 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  57.14 
 
 		 319 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  60.67 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  57.37 
 
 		 321 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  56.73 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  57.23 
 
 		 332 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  54.09 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  58.75 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  55.74 
 
 		 319 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  55.66 
 
 		 323 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  57.29 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  53.02 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  50.6 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  51.09 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  41.12 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  44.19 
 
 		 766 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  48.56 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  49.53 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  41.27 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  45.48 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  45.48 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  44.68 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  43.19 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  45.21 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  43.46 
 
 		 325 aa  232  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  40.86 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  40.86 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  45.66 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.34 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  41.92 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  46.53 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  42.48 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  38.87 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  41.83 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  40.06 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  42.24 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  44.48 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  44.58 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  44.62 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.08 
 
 		 723 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.92 
 
 		 325 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.75 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  39.27 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  40.68 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  43.23 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.39 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.58 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  42.12 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.37 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.01 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  38.92 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  40.51 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  44.08 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  39.81 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  41.38 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  42.12 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  42.12 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  42.72 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  40.06 
 
 		 328 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  41.18 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  39.94 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  42.72 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  41.8 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  40.07 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  41.16 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  41 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  37.17 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  40.71 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  39.81 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  40.13 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.79 
 
 		 334 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  40.59 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  40.92 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  39.51 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  42.57 
 
 		 324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  39.87 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  36.22 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  39.55 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  40.4 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  39.23 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  39.23 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  39.55 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  38.05 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  38.39 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  33.02 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  38.34 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  38.63 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  38.08 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  38.39 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  34.73 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  40.79 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  38.24 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>