132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0024 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  97.55 
 
 		 326 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  85.58 
 
 		 326 aa  567  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  38.39 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43.08 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  40.43 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  41.25 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  43.37 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  43.37 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  43.37 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  42.72 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  43.09 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  43.75 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  41.45 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  41.03 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  42.3 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  43.6 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  43 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  42.41 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  43.81 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  43.71 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  40.67 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  43.37 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  42.44 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  44.16 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  37.95 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  39.55 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  41.07 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.06 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  40.06 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  40.39 
 
 		 766 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  41.07 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  43.09 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.72 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  40.58 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  42.43 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  40.91 
 
 		 723 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  42.44 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  45.37 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  42.09 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.93 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  39.81 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  41.85 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  42.91 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  42.17 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  42.06 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  41.88 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  37.01 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  38.6 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  42.86 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  41.99 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  41.39 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  39.6 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  38.49 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  41.58 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  43.93 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  39.34 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  40.58 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  37.83 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  37.83 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  39.05 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  40.82 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  39.41 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  39.41 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  34.52 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.79 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  42.21 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  38.03 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  38.03 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  40.69 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  40.26 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  40.24 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  35.13 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  38.99 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  39.94 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  39.1 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  37.46 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  41.29 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  38.24 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  40.28 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  39.93 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  39.53 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  38.87 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  35.76 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  38.99 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  36.3 
 
 		 325 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  38.28 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  41.69 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  35.29 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  35.58 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13323  hypothetical protein  31.69 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  39.94 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  40.18 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  36.61 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  40.18 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  34.5 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  36.14 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  38.96 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>