131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0041 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  98.22 
 
 
337 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  98.22 
 
 
337 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  96.14 
 
 
337 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  95.85 
 
 
337 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  93.18 
 
 
337 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  89.61 
 
 
337 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  69.77 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  69.77 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  69.45 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  68.17 
 
 
324 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  64.17 
 
 
339 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  58.51 
 
 
336 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  54.58 
 
 
327 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  53.78 
 
 
323 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  54.81 
 
 
323 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  54.92 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  52.29 
 
 
321 aa  318  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  52.4 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  53.33 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  53.55 
 
 
330 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  52.38 
 
 
323 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  50.31 
 
 
325 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  48.33 
 
 
329 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  53.72 
 
 
327 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  51.25 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  48.89 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  52.08 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  49.23 
 
 
326 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  51.28 
 
 
325 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  50.81 
 
 
325 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  47.73 
 
 
320 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  50.49 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  51.15 
 
 
723 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  47.83 
 
 
348 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  48.18 
 
 
320 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  43.77 
 
 
318 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  47.27 
 
 
326 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  48.52 
 
 
310 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  45.7 
 
 
308 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  45.13 
 
 
334 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  48.59 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  49.16 
 
 
310 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  48.68 
 
 
310 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  48.14 
 
 
324 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  44.95 
 
 
314 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  44.34 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  45.4 
 
 
312 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.95 
 
 
337 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  43 
 
 
315 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  44.74 
 
 
328 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  43.32 
 
 
315 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  43.08 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  46.44 
 
 
324 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  42.53 
 
 
315 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  42.53 
 
 
325 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  43.83 
 
 
341 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  42.05 
 
 
766 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  46.44 
 
 
324 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  46.44 
 
 
324 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  41.83 
 
 
324 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  42.36 
 
 
328 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  46.82 
 
 
319 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.46 
 
 
339 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  44.26 
 
 
321 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  47.96 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  43.28 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  45.1 
 
 
333 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  45.75 
 
 
328 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  45.15 
 
 
373 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  41.8 
 
 
344 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  46.08 
 
 
318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  42 
 
 
412 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  41.8 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.6 
 
 
332 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  37.66 
 
 
339 aa  216  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  44.63 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  42.01 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  44.7 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  38.28 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  43.81 
 
 
348 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  43.92 
 
 
321 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  43.92 
 
 
321 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  43.92 
 
 
321 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  45.19 
 
 
326 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  44.3 
 
 
318 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  41.12 
 
 
362 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  42.72 
 
 
328 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  43.51 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  44.37 
 
 
324 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  44.26 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  42.39 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  37.83 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.73 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  42.67 
 
 
341 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  36.76 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  41.35 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  43.29 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  44.98 
 
 
330 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>