131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2116 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  95.02 
 
 		 321 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  62.73 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  63.09 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  59.49 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  58.57 
 
 		 326 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  63.97 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  63.17 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  58.8 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  58.8 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  58.8 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  60.87 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  58.23 
 
 		 318 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  61.95 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  57.48 
 
 		 321 aa  338  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  56.73 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  59.41 
 
 		 319 aa  328  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  56.73 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  59.18 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  58.8 
 
 		 321 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  52.17 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  51.98 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  49.21 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  46.79 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  45.14 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  42.38 
 
 		 766 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.45 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.07 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  47.32 
 
 		 723 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  46.53 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  44.82 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.59 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  36.92 
 
 		 325 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  37.66 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  42.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  42.72 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  46.73 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  42.05 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  39.02 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  45.42 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  42.43 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  43.81 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  39.02 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  42.95 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  43.61 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  43 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  43.61 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  45.57 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  43.45 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  45.57 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.59 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  44.37 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  40.78 
 
 		 412 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  39.87 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  46.2 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  42.72 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  37.46 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  45.45 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  41.45 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  44.67 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.7 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.69 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  41.8 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.28 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  41.04 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  41.32 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  44.81 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  41.5 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  39.4 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  43.33 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  44.19 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  44.19 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  43.79 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  40.2 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  42.07 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  35.69 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  44.16 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  44.16 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  43.23 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  43 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  43.18 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  42.9 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  42.67 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  43.04 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  43.04 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  40.73 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  41.45 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  42.81 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  41.45 
 
 		 366 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  42.17 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  41.18 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  40.13 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  34.98 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  36.84 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  38.49 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  33 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  38.71 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>