131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2648 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  100 
 
 
319 aa  624  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  66.35 
 
 
326 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  61.28 
 
 
322 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  58.33 
 
 
321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  57.69 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  57.79 
 
 
324 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  60.26 
 
 
323 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  57.33 
 
 
321 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  58.63 
 
 
321 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  59.41 
 
 
321 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  59.67 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  58.49 
 
 
318 aa  322  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  57.48 
 
 
321 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  57.48 
 
 
321 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  57.48 
 
 
321 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  55.74 
 
 
359 aa  315  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  57.61 
 
 
319 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  58.33 
 
 
324 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  57.29 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  53.96 
 
 
399 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  53.27 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  53.25 
 
 
333 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  50.81 
 
 
330 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  47.59 
 
 
328 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  41.69 
 
 
339 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.86 
 
 
337 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  40.26 
 
 
766 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  45.36 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  44.48 
 
 
342 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  42.11 
 
 
341 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  44.26 
 
 
346 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  46.49 
 
 
337 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  38.74 
 
 
324 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  46.49 
 
 
337 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  38.74 
 
 
325 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  46.82 
 
 
337 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.12 
 
 
310 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  41.98 
 
 
325 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  45.82 
 
 
337 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  45.67 
 
 
337 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  46.46 
 
 
327 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  46.15 
 
 
337 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  45.48 
 
 
337 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  44.88 
 
 
330 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  38.82 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  38.82 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  44.44 
 
 
326 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.28 
 
 
320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.27 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.67 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  42.28 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.22 
 
 
723 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.1 
 
 
321 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  43.37 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  45.58 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  42.91 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  45.42 
 
 
325 aa  195  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  38.08 
 
 
325 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.31 
 
 
318 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.15 
 
 
325 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  41.81 
 
 
323 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  40.07 
 
 
373 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.39 
 
 
325 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  41.16 
 
 
327 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  41.75 
 
 
310 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  39.68 
 
 
328 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  43.81 
 
 
325 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  41.83 
 
 
310 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  43.45 
 
 
324 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  39.41 
 
 
348 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  43.39 
 
 
339 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  40.56 
 
 
354 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  35.95 
 
 
339 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  42.24 
 
 
323 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43 
 
 
326 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  42.51 
 
 
348 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  39.74 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  40.47 
 
 
362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  42.62 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  39.33 
 
 
320 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  37.17 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  40.4 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  33.99 
 
 
330 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.87 
 
 
334 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  41.69 
 
 
323 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  39.69 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  39.34 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  40.68 
 
 
323 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  39.3 
 
 
328 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  33.9 
 
 
333 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  38.05 
 
 
324 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  42.56 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  42.56 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  36.95 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  42.56 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  37.42 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.55 
 
 
325 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  36.05 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  33.55 
 
 
315 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>