132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0685 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  51.67 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  51.98 
 
 
321 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  51.31 
 
 
321 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  51.47 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  51.47 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  51.47 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  52.61 
 
 
321 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  51.79 
 
 
332 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  50 
 
 
324 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  46.89 
 
 
766 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  50.65 
 
 
326 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  49.84 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  43.69 
 
 
339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  44.95 
 
 
337 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  43.93 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  51.97 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  43.93 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  43.14 
 
 
324 aa  245  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  42.81 
 
 
325 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  49.53 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  50.5 
 
 
322 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  50 
 
 
333 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  47.56 
 
 
399 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  50.16 
 
 
323 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  50.48 
 
 
319 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  49.37 
 
 
319 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  47.95 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  48.48 
 
 
328 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  49.21 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  46.6 
 
 
346 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  45.11 
 
 
328 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  38.11 
 
 
339 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  45.39 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  49.03 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  46.08 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  46.38 
 
 
310 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  42.04 
 
 
341 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  46.62 
 
 
330 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  43.09 
 
 
323 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  43.91 
 
 
723 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  44.12 
 
 
321 aa  205  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  46.05 
 
 
310 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  43.79 
 
 
326 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  41.23 
 
 
325 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  43.27 
 
 
323 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  44.22 
 
 
324 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  41.4 
 
 
325 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  202  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  45.45 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  45.45 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  44.81 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  45.54 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  45.48 
 
 
324 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  45.75 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  42.95 
 
 
323 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  36.99 
 
 
325 aa  195  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.29 
 
 
334 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  44.74 
 
 
320 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  36.96 
 
 
333 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  42.81 
 
 
336 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  40.98 
 
 
329 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  41.97 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  40.58 
 
 
328 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  45.6 
 
 
337 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  44.98 
 
 
337 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  41.9 
 
 
354 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  41.29 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  45.28 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  42.11 
 
 
325 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  39.61 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  35.62 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  42.46 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  40.74 
 
 
373 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  44.98 
 
 
337 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13323  hypothetical protein  34.54 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  42.16 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  44.3 
 
 
337 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  44.3 
 
 
337 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  41.83 
 
 
325 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.46 
 
 
334 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  38.84 
 
 
324 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  39.81 
 
 
348 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  36.93 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  42.09 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  39.81 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  40.58 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  35.48 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  35.24 
 
 
330 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  38.96 
 
 
412 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  34.82 
 
 
334 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  38.31 
 
 
328 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  34.84 
 
 
329 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  36.27 
 
 
308 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1582  hypothetical protein  41.9 
 
 
354 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  42.03 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  41.69 
 
 
326 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>