129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0355 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  100 
 
 
330 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  81.52 
 
 
327 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  67.73 
 
 
325 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  68.44 
 
 
324 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  65.48 
 
 
325 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  64.84 
 
 
325 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  60.88 
 
 
323 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  60.59 
 
 
326 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  58.81 
 
 
323 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  57.93 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  56.82 
 
 
342 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  59.48 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  54.98 
 
 
321 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  52.55 
 
 
325 aa  329  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  55.37 
 
 
327 aa  328  9e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  56.68 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  55.88 
 
 
325 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  53.23 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  53.89 
 
 
336 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  51.11 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  56.48 
 
 
723 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  54.79 
 
 
339 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  49.36 
 
 
325 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  47.92 
 
 
318 aa  291  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  55.26 
 
 
324 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  53.12 
 
 
337 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  53.55 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  53.55 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  53.55 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  51.79 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  50 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  50.97 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  53.02 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  53.92 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  52.68 
 
 
310 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  52.35 
 
 
310 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  52.01 
 
 
310 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  53.92 
 
 
324 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  53.92 
 
 
324 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  54.28 
 
 
324 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  49.03 
 
 
334 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  52.94 
 
 
337 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  52.94 
 
 
337 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  52 
 
 
324 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  47.73 
 
 
326 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  52 
 
 
324 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  52 
 
 
324 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  50.64 
 
 
333 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  50.81 
 
 
333 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  43.51 
 
 
334 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  48.98 
 
 
324 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  48.86 
 
 
328 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  46.44 
 
 
308 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  47.12 
 
 
312 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  46.31 
 
 
328 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  44.73 
 
 
321 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  45.54 
 
 
325 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  45.58 
 
 
412 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  44.92 
 
 
366 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  44.56 
 
 
373 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  42.95 
 
 
315 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  42.9 
 
 
315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  41.96 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  42.62 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  43.54 
 
 
348 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  46.53 
 
 
321 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  48.42 
 
 
328 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  47.55 
 
 
318 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  46.53 
 
 
321 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  44 
 
 
341 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  44.01 
 
 
766 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  44.07 
 
 
362 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  39.67 
 
 
315 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  45.66 
 
 
359 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.65 
 
 
339 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  42.68 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  44.93 
 
 
371 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  48.04 
 
 
328 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.98 
 
 
339 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  43.56 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  48.87 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.53 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  46.3 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  46.69 
 
 
326 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  46.37 
 
 
330 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  43.93 
 
 
321 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  46.28 
 
 
322 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  39.42 
 
 
333 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  46.18 
 
 
323 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  36.99 
 
 
324 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.85 
 
 
332 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  46.03 
 
 
324 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  43.04 
 
 
326 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  44.55 
 
 
346 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  42.72 
 
 
326 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  42.94 
 
 
399 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  42.67 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  42.67 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  42.67 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  38.28 
 
 
344 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>