130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1079 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  100 
 
 
328 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  59.49 
 
 
321 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  59.18 
 
 
321 aa  342  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  58.88 
 
 
323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  60.07 
 
 
320 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  57.83 
 
 
332 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  59.48 
 
 
324 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  58.23 
 
 
326 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  58.39 
 
 
322 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  58.1 
 
 
319 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  59.02 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  57.01 
 
 
318 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  53.27 
 
 
319 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  53.44 
 
 
321 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  51.41 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  51.09 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  53.11 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  50.43 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  45.45 
 
 
337 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  43.61 
 
 
339 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  51.13 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  47.04 
 
 
766 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  44.59 
 
 
324 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  48.48 
 
 
330 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  43.61 
 
 
344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  43.61 
 
 
344 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  42.17 
 
 
325 aa  235  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  46.33 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  48.23 
 
 
330 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  49.2 
 
 
328 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  43 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  45.86 
 
 
333 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  40.5 
 
 
325 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  46.56 
 
 
346 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.52 
 
 
334 aa  222  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  45.1 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.59 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  37.85 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  44.26 
 
 
323 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  45.22 
 
 
333 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.65 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  42.36 
 
 
412 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  37.94 
 
 
339 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  45.02 
 
 
325 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  43.23 
 
 
341 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  44.81 
 
 
362 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43.83 
 
 
326 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  44.41 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  43.83 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  41.08 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  43.93 
 
 
310 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  43.42 
 
 
334 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  44.87 
 
 
373 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.08 
 
 
723 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  45.43 
 
 
324 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  42.45 
 
 
323 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.3 
 
 
325 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  44.27 
 
 
320 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  43.91 
 
 
348 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  45.28 
 
 
327 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  44.73 
 
 
323 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  42.39 
 
 
312 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  43.91 
 
 
366 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  46.13 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  46.43 
 
 
337 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.51 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  43.44 
 
 
328 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.37 
 
 
320 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  42.9 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  42.9 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  45.25 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  40.72 
 
 
308 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  42.95 
 
 
326 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  45.81 
 
 
324 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  45.81 
 
 
324 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  43.18 
 
 
371 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  40 
 
 
354 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  45.28 
 
 
337 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  44.89 
 
 
324 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  41.99 
 
 
326 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  42.21 
 
 
339 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  40.78 
 
 
326 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  43.93 
 
 
325 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  43.93 
 
 
325 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  44.81 
 
 
337 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  44.81 
 
 
337 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  44.16 
 
 
337 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  44.16 
 
 
337 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  44.81 
 
 
337 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  39.3 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  39.82 
 
 
326 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  40.63 
 
 
336 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  36.84 
 
 
334 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  37.94 
 
 
348 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  40.12 
 
 
328 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  37.1 
 
 
329 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>