129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1724 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  57.89 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  56.07 
 
 		 373 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  55.76 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  57.32 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  57.61 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  55.76 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  54.32 
 
 		 371 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  53.8 
 
 		 333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  53.97 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  52.77 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  48.53 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  53.25 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  50.32 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  46.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  45.51 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  50.33 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  48.04 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  44.19 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  44.69 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  42.63 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  43.35 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  43.73 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  45.16 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  44.94 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.48 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  45.63 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  45.69 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  43.09 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  39.56 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  47.54 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  45.54 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  42.48 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  48.18 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  43.04 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  42.39 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  47.21 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.41 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  47.21 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  47.21 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  44.12 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.23 
 
 		 723 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  46.03 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  39.76 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  41.8 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  43.35 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  40.71 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  40.13 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  42.5 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.74 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  40.94 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  42.49 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  39.74 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  42.49 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  42.72 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  42.72 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  42.72 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  41.35 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  42.41 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  42.41 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  37.7 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.29 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  40.71 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  40.13 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  42.72 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  39.3 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  35.35 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.31 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  40.3 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  40.5 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  39.31 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  34.98 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  41.88 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  34.82 
 
 		 325 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  38.68 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  40.65 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  38.34 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  34.98 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  39.27 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  40.97 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  33.13 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  37.74 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.62 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  41.64 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  34.71 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  39.81 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  33.97 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  36.05 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  38.61 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  38.48 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  33.97 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  38.71 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  38.71 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  38.71 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>