131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3264 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  57.28 
 
 
326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  51.58 
 
 
325 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  51.91 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  53.14 
 
 
325 aa  309  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  53.14 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  53.72 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  51.46 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  48.62 
 
 
348 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  52.48 
 
 
325 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  50 
 
 
342 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  49.51 
 
 
723 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  51.97 
 
 
324 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  51.16 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  52.79 
 
 
339 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  50.66 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  49.36 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  49.5 
 
 
321 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  49.83 
 
 
325 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  45.87 
 
 
318 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  48.69 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  48.73 
 
 
320 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  46.56 
 
 
323 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  47.72 
 
 
337 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  42.95 
 
 
334 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  44.75 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  47.37 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  45.43 
 
 
323 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  47.09 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  47.09 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  47.68 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  47.09 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  47.09 
 
 
337 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  46.79 
 
 
320 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  43.53 
 
 
324 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  49.18 
 
 
324 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  46.65 
 
 
323 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  43.27 
 
 
325 aa  258  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  48.85 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  48.85 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  48.99 
 
 
323 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  48.85 
 
 
324 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  46.49 
 
 
310 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  46.82 
 
 
310 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  46.73 
 
 
324 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  41.18 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  45.48 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  40.94 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  42.81 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  41.83 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  47.19 
 
 
324 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  47.19 
 
 
324 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  41.83 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  44.44 
 
 
328 aa  235  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  41.67 
 
 
308 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  42.24 
 
 
321 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  41.45 
 
 
315 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  42.9 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  42.52 
 
 
373 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  39.16 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  42.52 
 
 
366 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  42.19 
 
 
348 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  40.82 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  42 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  39.75 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  40.45 
 
 
318 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  40.2 
 
 
337 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  40.32 
 
 
317 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  37.9 
 
 
344 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  37.9 
 
 
344 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  41.28 
 
 
333 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  37.78 
 
 
325 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  41.28 
 
 
333 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  40.07 
 
 
766 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  39.13 
 
 
362 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  41.41 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  41.41 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  41.41 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  37.13 
 
 
325 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  38.92 
 
 
359 aa  199  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  39.93 
 
 
412 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  36.59 
 
 
324 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  37.14 
 
 
315 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  40.65 
 
 
346 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  39.1 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  39.74 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  39.48 
 
 
371 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  39.76 
 
 
328 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  40.98 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.26 
 
 
323 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  39.6 
 
 
320 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  40.78 
 
 
318 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  40.2 
 
 
417 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  36.22 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  39.3 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  40.53 
 
 
341 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  36.83 
 
 
321 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>