131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2197 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  57.28 
 
 		 329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  52.88 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  54.29 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  53.63 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  52.96 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  53.4 
 
 		 326 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  55.45 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  51.09 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  53.29 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  53.62 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  52.98 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  51.11 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  52.32 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  53.65 
 
 		 323 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  53.25 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  47.85 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  51.97 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  49.19 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  53.62 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  54.79 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  50.32 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  50.16 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  49.18 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  48.85 
 
 		 723 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  48.85 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  49.54 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  47.87 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  48.4 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  45.28 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  49.84 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  48.9 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  49.53 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  48.92 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  48.92 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  48.92 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  45.19 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  49.51 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  49.51 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  46.03 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  48.52 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  49.5 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  48.3 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  48.3 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  44.03 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  49.51 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  49.51 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  49.51 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  48.51 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  48.51 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  46.82 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  45.39 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  42.95 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  43.17 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  43.24 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  42.81 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  42.47 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  43.79 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  42.14 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  41.31 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  43.71 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  37.95 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  43.38 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  40.67 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  43.08 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  41.3 
 
 		 766 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  42.49 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  42.43 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.07 
 
 		 339 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  43.99 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  39.24 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  41.91 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  39 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  39.04 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  39 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  42.72 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  42.48 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  41.35 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  40.89 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  39.81 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  43.83 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  41.29 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  41.8 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  42.91 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  41.91 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  41.91 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  41.91 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  43.45 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  38.98 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  38.67 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  37.67 
 
 		 325 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  41.72 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  43.77 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  40.71 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.72 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>