129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2568 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  64.35 
 
 
315 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  65.5 
 
 
314 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  63.38 
 
 
315 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  61.72 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  47.76 
 
 
325 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  47.94 
 
 
342 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  45.13 
 
 
326 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  49 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.99 
 
 
321 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  48.33 
 
 
336 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  43.99 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  43.28 
 
 
327 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  44.3 
 
 
323 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  43.75 
 
 
325 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  43.85 
 
 
323 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  44.92 
 
 
320 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  44.3 
 
 
325 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.3 
 
 
325 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  42.95 
 
 
326 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  46.34 
 
 
337 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  44.81 
 
 
323 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  45.18 
 
 
330 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  44.22 
 
 
320 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  44.82 
 
 
337 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  43.55 
 
 
325 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  44.34 
 
 
337 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  46.37 
 
 
324 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  44.51 
 
 
337 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  44.48 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  43.55 
 
 
326 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  47.04 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  47.04 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  43.42 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  44.21 
 
 
337 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  44.21 
 
 
337 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.48 
 
 
723 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  44.08 
 
 
327 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.11 
 
 
310 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  37.1 
 
 
318 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  46.71 
 
 
324 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  42.24 
 
 
329 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  38.56 
 
 
334 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  45.76 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  43.33 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  41.06 
 
 
348 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  42.42 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  40.58 
 
 
325 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  42.42 
 
 
310 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.74 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  41 
 
 
328 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  40.06 
 
 
324 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  40.67 
 
 
328 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  40.39 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  39.6 
 
 
373 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  39.74 
 
 
324 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  39.74 
 
 
324 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  38.59 
 
 
348 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  39.6 
 
 
366 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  41.69 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  37 
 
 
308 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  38.49 
 
 
312 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  35.88 
 
 
362 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  39.55 
 
 
318 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  38.98 
 
 
328 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  38.83 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  38.56 
 
 
333 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  39.53 
 
 
317 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  38.56 
 
 
321 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  29.53 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  34.63 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  37.83 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  36.21 
 
 
371 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  37.29 
 
 
321 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  37.29 
 
 
321 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  37.29 
 
 
321 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  37.34 
 
 
321 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  32.46 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  38.1 
 
 
317 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  34.43 
 
 
325 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  39.53 
 
 
320 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  31.37 
 
 
339 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  34.21 
 
 
318 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  37.37 
 
 
330 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  36.75 
 
 
341 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  36.62 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  30.52 
 
 
325 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  36.59 
 
 
326 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  36.16 
 
 
321 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  36.48 
 
 
324 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  31.35 
 
 
324 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  36.62 
 
 
328 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  36.75 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  35.78 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  36.36 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  30.23 
 
 
344 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  30.23 
 
 
344 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  30.07 
 
 
339 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  35.6 
 
 
326 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>