130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4562 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  54.93 
 
 
325 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  57.48 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  56.68 
 
 
323 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  54.34 
 
 
326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  55.05 
 
 
325 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  55.16 
 
 
323 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  52.4 
 
 
323 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  56 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  57.73 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  53.29 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  53.23 
 
 
325 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  53.44 
 
 
325 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  54.72 
 
 
325 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  54.72 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  52.32 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  51.12 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  50 
 
 
329 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  47.51 
 
 
318 aa  298  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  53.14 
 
 
723 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  52.94 
 
 
323 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  50.31 
 
 
326 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  49.36 
 
 
327 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  53.02 
 
 
336 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  52.22 
 
 
337 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  53.36 
 
 
310 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  53.14 
 
 
323 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  53.2 
 
 
310 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  52.68 
 
 
310 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  52.79 
 
 
337 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  51.91 
 
 
337 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  50.49 
 
 
348 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  49.38 
 
 
320 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  52.08 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  52.08 
 
 
337 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  51.58 
 
 
337 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  51.58 
 
 
337 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  49.67 
 
 
334 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  51.79 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  51.79 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  44.07 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  51.79 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  50.97 
 
 
324 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  48.85 
 
 
314 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  50.16 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  49.19 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  49.84 
 
 
333 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  47.16 
 
 
315 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  48.74 
 
 
324 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  46.13 
 
 
315 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  47.94 
 
 
321 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  48.74 
 
 
324 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  48.5 
 
 
328 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  50.17 
 
 
328 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  46.49 
 
 
328 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  45.24 
 
 
308 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  46.86 
 
 
373 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  46.18 
 
 
315 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  46.2 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  49.31 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  46.32 
 
 
366 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  45.57 
 
 
766 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  45.07 
 
 
412 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  48.17 
 
 
321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  48.17 
 
 
321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  48.17 
 
 
321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  46.28 
 
 
312 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  46.34 
 
 
324 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  43.89 
 
 
325 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.83 
 
 
337 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  46.84 
 
 
321 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  44.04 
 
 
362 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  39.34 
 
 
339 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  43.52 
 
 
318 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  47.16 
 
 
320 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  45.15 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  39.1 
 
 
344 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  39.1 
 
 
344 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  44.82 
 
 
321 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  46.33 
 
 
328 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.74 
 
 
339 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  40.53 
 
 
325 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  43.22 
 
 
321 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  47.35 
 
 
321 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  46.69 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  40.8 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  37.71 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  43.81 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  44.63 
 
 
326 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  41.07 
 
 
417 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  46.78 
 
 
322 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  42.72 
 
 
371 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  44.48 
 
 
359 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  42.37 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  37.9 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  43.56 
 
 
324 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  44.48 
 
 
319 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.46 
 
 
334 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>