128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2684 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  100 
 
 
315 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  94.92 
 
 
315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  86.94 
 
 
314 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  70.1 
 
 
315 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  63.38 
 
 
321 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  46.84 
 
 
325 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  47.87 
 
 
326 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  47.16 
 
 
342 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  44.55 
 
 
326 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  41.88 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.08 
 
 
339 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.91 
 
 
320 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  41.56 
 
 
321 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  44.22 
 
 
723 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  41.83 
 
 
329 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  41.91 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.48 
 
 
320 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  42.48 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  42.47 
 
 
336 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  42.62 
 
 
330 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  44.04 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  42.81 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.64 
 
 
325 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  43.29 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  41.72 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  40.84 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  36.04 
 
 
318 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  43.38 
 
 
327 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  41.75 
 
 
310 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  43 
 
 
337 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  40.26 
 
 
325 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  42.67 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  40.26 
 
 
325 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  42.35 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  41.72 
 
 
323 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  41.2 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  43.38 
 
 
328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.8 
 
 
334 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.67 
 
 
325 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  42.35 
 
 
337 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  35.85 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  40.86 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  41.69 
 
 
324 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  41.25 
 
 
348 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  41.81 
 
 
328 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  38.56 
 
 
324 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  41.64 
 
 
323 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  38.24 
 
 
324 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  38.24 
 
 
324 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  39.19 
 
 
317 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  36.6 
 
 
366 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  39.4 
 
 
317 aa  188  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  38.16 
 
 
318 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  33.99 
 
 
337 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  38.44 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  31.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  35.71 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  36.36 
 
 
362 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  35.03 
 
 
348 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  32.68 
 
 
344 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.65 
 
 
766 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  32.68 
 
 
344 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  37.75 
 
 
318 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  36.3 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  36.3 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  36.3 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  33.23 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  34.84 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  35.43 
 
 
321 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  37.7 
 
 
333 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  37.38 
 
 
333 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  34.77 
 
 
412 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  30.69 
 
 
339 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  31.25 
 
 
339 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  36.05 
 
 
328 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  38.89 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  37.22 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  37.1 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  35.64 
 
 
321 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  36.74 
 
 
326 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  36.75 
 
 
319 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  35.2 
 
 
330 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  34.73 
 
 
341 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  31.05 
 
 
325 aa  158  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  30.82 
 
 
324 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  36.67 
 
 
346 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  35.43 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  34.87 
 
 
321 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  32.89 
 
 
318 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  33.55 
 
 
325 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  35.69 
 
 
322 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  34.87 
 
 
321 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  35.14 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>