131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3659 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  100 
 
 		 339 aa  683    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  69.54 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  68.2 
 
 		 324 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  66.56 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  66.56 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  66.23 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  64.82 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  64.82 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  65.47 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  65.47 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  64.17 
 
 		 337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  64.17 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  64.17 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  57.81 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  55.81 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  57.53 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  57.73 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  56.07 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  53.44 
 
 		 326 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  55.48 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  56.11 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  55.78 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  55.81 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  53.25 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  53.02 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  55.88 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  54.79 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  56.44 
 
 		 327 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  55.12 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  54.92 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  54.15 
 
 		 324 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  52.79 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  55.45 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  51.66 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  54.76 
 
 		 320 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  52.96 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  49.84 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  44.55 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  45.02 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  48.55 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  49.18 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  49.67 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  50.16 
 
 		 723 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  49.35 
 
 		 310 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  46.33 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  53.74 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  48.25 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  43.38 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  43.95 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  44.74 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  45.48 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  42.76 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  44.37 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  45.77 
 
 		 366 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  45.19 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  43.51 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  47.51 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  44.7 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  47.65 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  45.03 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  50.5 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  49.5 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  49.5 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  45.42 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  46.41 
 
 		 766 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  43.07 
 
 		 341 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  45.66 
 
 		 318 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  46.39 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  43.39 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  43.09 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  49.83 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  43.14 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  45.95 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  42.38 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  42.38 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  42.05 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  41.06 
 
 		 325 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  43.54 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  46 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  46.18 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.51 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  44.75 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  43.38 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  44.33 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  44.75 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  43.23 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  46.1 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  42.62 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  44.63 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  45.7 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  40.8 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  44.79 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  44.41 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  39.32 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  38.44 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>