130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2566 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  73.12 
 
 
371 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  63.23 
 
 
373 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  62.58 
 
 
348 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  57.69 
 
 
366 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  57.28 
 
 
328 aa  345  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  55.41 
 
 
312 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  54.79 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  54.13 
 
 
333 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  53.2 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  53.27 
 
 
341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  49.49 
 
 
315 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  51 
 
 
412 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  53.82 
 
 
417 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  46.1 
 
 
325 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  44.04 
 
 
342 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.19 
 
 
321 aa  238  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  44 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  43.13 
 
 
323 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  44.01 
 
 
320 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  46.03 
 
 
348 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  46.26 
 
 
324 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  41.55 
 
 
325 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  42.18 
 
 
323 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  42.77 
 
 
320 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  44.07 
 
 
330 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  40.86 
 
 
327 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  41.39 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  45.95 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  42.71 
 
 
325 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  41.78 
 
 
334 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  41.91 
 
 
326 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  42.71 
 
 
325 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  42.86 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  44.41 
 
 
336 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  44.22 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  40.33 
 
 
323 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  44.77 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  41.81 
 
 
723 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  42.47 
 
 
325 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  39.24 
 
 
326 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  42.28 
 
 
318 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  39.81 
 
 
334 aa  209  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  42.09 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  44.81 
 
 
328 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  41.45 
 
 
321 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  39.13 
 
 
329 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  41.64 
 
 
321 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  38.24 
 
 
318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  41.11 
 
 
324 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  43.62 
 
 
324 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  42 
 
 
310 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  41.75 
 
 
310 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  43.62 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  43.62 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  45.27 
 
 
323 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  41.45 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.24 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  41.45 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  41.12 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  41.37 
 
 
326 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  39.87 
 
 
321 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  39.47 
 
 
324 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  42.02 
 
 
318 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  40.46 
 
 
337 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  40.46 
 
 
337 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  40.13 
 
 
337 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  40.79 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  39.4 
 
 
324 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  39.4 
 
 
324 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  36.88 
 
 
318 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  39.32 
 
 
324 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  41.25 
 
 
323 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  41.45 
 
 
319 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  38.69 
 
 
321 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  40.47 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  35.22 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  35.55 
 
 
337 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.58 
 
 
334 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  38.17 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  38.87 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  38.87 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  38.87 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  35.88 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  36 
 
 
325 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  38.96 
 
 
341 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  36.36 
 
 
315 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  34.59 
 
 
324 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  34.42 
 
 
333 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  40.07 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  41.22 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  41.45 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  36.04 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  38.54 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>