130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1660 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  52.03 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  50.68 
 
 		 373 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  51.52 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  49.49 
 
 		 362 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  50.5 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  47.88 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  47.84 
 
 		 417 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  45.45 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  46.46 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  45.12 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  47.14 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  44.78 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  43.96 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  42.09 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  42.76 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  39.67 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  41.08 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  35.55 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  40.48 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  37.71 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  37.71 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  41.36 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  37.94 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  36.82 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  40.07 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  38.61 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  38.05 
 
 		 323 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  38.75 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  39.04 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  37.71 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  39.06 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  35.57 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  35.88 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  35.67 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  36.24 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  37.37 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  38.61 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  40.57 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  38.49 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  38.91 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  37.59 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  38.28 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  39.02 
 
 		 337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  37.59 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  35.23 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  39.02 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  36.33 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  37.14 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  37.62 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  37.62 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  38.61 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  37.92 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  37.92 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  37.21 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  37.62 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  37.75 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  37.75 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  37.76 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  35.08 
 
 		 723 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  34.33 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  37.21 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  34.95 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  31.11 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  31.43 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  34.9 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  34.98 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  33.88 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  34.98 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  33.55 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  36.96 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  34.27 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  33.55 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.76 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  32.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  32.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  32.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  32.75 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  30.41 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  34.47 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  33.96 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  33.55 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  29.53 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  33.55 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  32.52 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  35.29 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  33.22 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  33.86 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  33.66 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  34.64 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  32.48 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  32.05 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  36.18 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>