133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  100 
 
 
324 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  62.73 
 
 
321 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  61.8 
 
 
321 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  60.88 
 
 
320 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  62.83 
 
 
323 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  60.33 
 
 
318 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  58.17 
 
 
326 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  57.79 
 
 
319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  55.66 
 
 
332 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  61.18 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  56.48 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  60.68 
 
 
322 aa  329  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  56.62 
 
 
321 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  57.76 
 
 
324 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  56.81 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  59.03 
 
 
328 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  54.49 
 
 
321 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  54.49 
 
 
321 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  54.49 
 
 
321 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  53.02 
 
 
359 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  52.65 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  48.85 
 
 
399 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  47.68 
 
 
766 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  50.81 
 
 
328 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  50.45 
 
 
330 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  45.7 
 
 
339 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  43.61 
 
 
344 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  43.61 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  42.99 
 
 
337 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  40.43 
 
 
324 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  46.91 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  38.59 
 
 
339 aa  231  9e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  39.8 
 
 
325 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43.79 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.65 
 
 
310 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  42.53 
 
 
341 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  44.38 
 
 
310 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  44.82 
 
 
326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  44.38 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.34 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  46.49 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  45.08 
 
 
323 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.33 
 
 
321 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.44 
 
 
325 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.61 
 
 
318 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  42.81 
 
 
323 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.88 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  46.03 
 
 
330 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  43.56 
 
 
342 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  44.13 
 
 
325 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  42.07 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  43.45 
 
 
723 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  45.78 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  45.51 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  39.93 
 
 
325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  41.78 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.9 
 
 
320 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  43.23 
 
 
325 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  47.37 
 
 
324 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.63 
 
 
339 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  42.22 
 
 
346 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  41.69 
 
 
328 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  44.82 
 
 
323 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  43.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  35.9 
 
 
334 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  39.35 
 
 
412 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  45.03 
 
 
337 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  43.71 
 
 
324 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  43.71 
 
 
324 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  43.71 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  39.47 
 
 
362 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  39.37 
 
 
354 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  43.29 
 
 
336 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  41.03 
 
 
312 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.95 
 
 
334 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.33 
 
 
334 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  41.07 
 
 
328 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  44.04 
 
 
337 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  34.06 
 
 
333 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  41.56 
 
 
326 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  44.04 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  44.04 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  44.37 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  40.72 
 
 
373 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  40.85 
 
 
333 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  41.04 
 
 
326 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  43.71 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  38.29 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  40.26 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  43.71 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  43.09 
 
 
324 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  40.2 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  39.41 
 
 
348 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3470  Protein of unknown function DUF2260  40.2 
 
 
333 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  35.37 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  38.61 
 
 
328 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  37.54 
 
 
314 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>