130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2631 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  100 
 
 
354 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1582  hypothetical protein  92.94 
 
 
354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  39.8 
 
 
321 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  37.84 
 
 
339 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  37.33 
 
 
766 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  33.54 
 
 
339 aa  195  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  40.74 
 
 
332 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  35.33 
 
 
337 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  40.26 
 
 
328 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  34.38 
 
 
325 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  39.53 
 
 
320 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  36.49 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  38.46 
 
 
341 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  39.37 
 
 
324 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  38.44 
 
 
323 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  40.56 
 
 
319 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  39.06 
 
 
326 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  37.12 
 
 
344 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  35.89 
 
 
325 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  37.12 
 
 
344 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  38.78 
 
 
319 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  37.12 
 
 
321 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  37.12 
 
 
321 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  37.12 
 
 
321 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  37.25 
 
 
325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  36.49 
 
 
321 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  37.38 
 
 
326 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  40 
 
 
322 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  40.2 
 
 
318 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  35.37 
 
 
329 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  35.58 
 
 
334 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  37.66 
 
 
325 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  37.46 
 
 
348 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  36.45 
 
 
321 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  35.78 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  38.29 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  35.76 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  37.66 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  33.84 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  36.59 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  36.39 
 
 
318 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  38.05 
 
 
337 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  37.11 
 
 
324 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  34.07 
 
 
325 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  36.45 
 
 
323 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  37.09 
 
 
323 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  32.31 
 
 
333 aa  169  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  35.67 
 
 
325 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  32.48 
 
 
330 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  38.51 
 
 
339 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  34.67 
 
 
342 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  33.98 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  35.11 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  36 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  34.41 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  35.62 
 
 
330 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  34.2 
 
 
359 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  35.1 
 
 
326 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  32.92 
 
 
318 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  38.02 
 
 
337 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  37.78 
 
 
323 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  37.8 
 
 
337 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  36.72 
 
 
325 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  35.71 
 
 
723 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  37.5 
 
 
337 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  34.92 
 
 
366 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  31.25 
 
 
326 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  35.4 
 
 
326 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  34.46 
 
 
412 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  34.32 
 
 
329 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  34.45 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  34.41 
 
 
323 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  34.68 
 
 
328 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  36.08 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  34.78 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  34.56 
 
 
310 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  37.14 
 
 
337 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  37.13 
 
 
336 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  36.23 
 
 
324 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  34.91 
 
 
333 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  34.23 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  36.58 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  36.58 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  33.89 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  34.86 
 
 
399 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  33.01 
 
 
323 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  32.14 
 
 
334 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  30.65 
 
 
314 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  36.36 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  35.33 
 
 
320 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  36.66 
 
 
328 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  33.97 
 
 
320 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  36.54 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  36.06 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>