130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1252 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  43.04 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  43.55 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  42.39 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  40.65 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13323  hypothetical protein  41.31 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  40.19 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  36.25 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  36.04 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  35.62 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  35.74 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.44 
 
 		 766 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  34.98 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  34.42 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  36.08 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  31.89 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  34.41 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  35.71 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  34.71 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  35.28 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  34.2 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.04 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  32.56 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  37.13 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  35.08 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  32.56 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  36.16 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  35.29 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  37.59 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  36.93 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  33.11 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  34.21 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  32.01 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  33.22 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  34.08 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  35.06 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  33.22 
 
 		 325 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  34.53 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  35.08 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  33.01 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  34.2 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  31.7 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  34.44 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  33 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  34.43 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  33.56 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  36.77 
 
 		 336 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  34.88 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  33.11 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  32.36 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  35.35 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  34.49 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  36.61 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  33.23 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  32.09 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  32.89 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  34.33 
 
 		 723 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  35.06 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  32.11 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  33.66 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  34.88 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  34.81 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  35.28 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  35.28 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  32.12 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  34.22 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  34.92 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  33.99 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  35.16 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  35.48 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  35.48 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  32.25 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  31.31 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  33.56 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  33.22 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  31.65 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  33.55 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  30.92 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  33.01 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  32.89 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  31.05 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  32.46 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  32.06 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  30.69 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  31.94 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>