132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3834 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  58.36 
 
 
326 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  52.05 
 
 
330 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13323  hypothetical protein  45.54 
 
 
322 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  43.73 
 
 
325 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1252  hypothetical protein  40.65 
 
 
314 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  38.2 
 
 
327 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2444  hypothetical protein  38.1 
 
 
329 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  38.2 
 
 
326 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  38.87 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  37.15 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  39.42 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  38.34 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  36.52 
 
 
324 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  38.44 
 
 
339 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  35.67 
 
 
337 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  33.66 
 
 
328 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  37.58 
 
 
337 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  39.63 
 
 
324 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  37.09 
 
 
318 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  35.95 
 
 
325 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  35.65 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  35.4 
 
 
323 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  34.69 
 
 
325 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  38.16 
 
 
326 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  35.86 
 
 
327 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  35.45 
 
 
328 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  38.36 
 
 
337 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  34.78 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  34.54 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  39.58 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  39.58 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  33.02 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  39.57 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  38.05 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  36.21 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  38.36 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  38.05 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  38 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  33.65 
 
 
723 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  38.05 
 
 
337 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  34.55 
 
 
325 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  34.22 
 
 
344 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  32.18 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  34.22 
 
 
344 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  35.14 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  32.18 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  34.87 
 
 
339 aa  179  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  36.28 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  37.37 
 
 
346 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  35.55 
 
 
766 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  35.69 
 
 
321 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  36.63 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  36.12 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  32.25 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  37.34 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  34.7 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  34.05 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  34.05 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  34.05 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  35.64 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  34.16 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  34.88 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  35.41 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  34.16 
 
 
321 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  35.02 
 
 
321 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  32.61 
 
 
324 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  37.18 
 
 
318 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  34.44 
 
 
310 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  34.11 
 
 
310 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
320 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  35.24 
 
 
330 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  35.25 
 
 
326 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  34.44 
 
 
310 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  34.56 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  32.89 
 
 
321 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  35.99 
 
 
334 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  31.87 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  35.71 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  32.69 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  33.12 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  31.46 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  36.39 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  34.23 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  34.32 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0024  hypothetical protein  36.61 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  31.46 
 
 
333 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  34.43 
 
 
329 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  36.4 
 
 
323 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  33.01 
 
 
324 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  32.44 
 
 
354 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4124  hypothetical protein  34.31 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  30.79 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  31.75 
 
 
324 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  32.15 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  34.02 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  33.45 
 
 
373 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  31.07 
 
 
359 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  33.03 
 
 
341 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  35.4 
 
 
332 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>