244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1506 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  76.56 
 
 
420 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  58.49 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  46.25 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  47.69 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  42.79 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  39.81 
 
 
432 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  37.98 
 
 
418 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  41.5 
 
 
374 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  42 
 
 
374 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  38.15 
 
 
432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  38.68 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  36.95 
 
 
424 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  35.77 
 
 
398 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  39.46 
 
 
386 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  35.7 
 
 
418 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.8 
 
 
444 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.25 
 
 
439 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  32.6 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 
442 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  30.75 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  32.18 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 
446 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.31 
 
 
487 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  30.8 
 
 
444 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.27 
 
 
468 aa  156  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.93 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.93 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  29.93 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
442 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  28.93 
 
 
446 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.36 
 
 
444 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  30.46 
 
 
766 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  26.14 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  29.9 
 
 
447 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  29.95 
 
 
437 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.04 
 
 
429 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  29.53 
 
 
425 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  29.6 
 
 
437 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  29.72 
 
 
429 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  29.93 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  30.22 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  29.93 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  27.74 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  28.85 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  28.47 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  29.97 
 
 
398 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  26.83 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  25.67 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  27.95 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.56 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  30.21 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  28.9 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.35 
 
 
384 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  29.71 
 
 
408 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 
429 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  29.9 
 
 
425 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 
434 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.69 
 
 
395 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
434 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  28.87 
 
 
386 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  28.43 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  27.51 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  28.76 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  28 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  29.37 
 
 
425 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  30.42 
 
 
430 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  28.46 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  27.92 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  27.57 
 
 
441 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  28.92 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  26.77 
 
 
430 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  26.56 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  28.75 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  28.83 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  30.03 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  27.14 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  28.79 
 
 
418 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
416 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  38.39 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  32.74 
 
 
418 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  27.14 
 
 
453 aa  114  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.65 
 
 
416 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  28.1 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  26.83 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  41.15 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  28.97 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  28.98 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  27.78 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 
418 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  28.91 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  28.02 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  29.18 
 
 
433 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  25.44 
 
 
819 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  28.47 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  30.79 
 
 
426 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>