More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4881 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  880    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  79.91 
 
 
429 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  880    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  79.77 
 
 
448 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  76.69 
 
 
425 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  67.82 
 
 
442 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  54.29 
 
 
433 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  50.96 
 
 
506 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  52.67 
 
 
442 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  52.2 
 
 
447 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  54.06 
 
 
444 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  53.6 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  52.53 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  52.46 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  50.44 
 
 
487 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  52.2 
 
 
446 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  51.78 
 
 
439 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  50.81 
 
 
437 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  50.45 
 
 
446 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  45.62 
 
 
437 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  44.37 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  39.72 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.03 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
416 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 
416 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  37.04 
 
 
766 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  39.21 
 
 
424 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  29.89 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.6 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  38.9 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  32.38 
 
 
819 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  33.18 
 
 
427 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  35.4 
 
 
374 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.53 
 
 
420 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.84 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  33.89 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  35.96 
 
 
425 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
434 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  35.03 
 
 
434 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  30.68 
 
 
398 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  33.96 
 
 
408 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 
439 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  34.92 
 
 
423 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  33.66 
 
 
430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  34.87 
 
 
434 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  33.02 
 
 
429 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  32.58 
 
 
438 aa  156  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.32 
 
 
409 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.1 
 
 
429 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  32.07 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  29.93 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  34.47 
 
 
428 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  31.83 
 
 
423 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  32.82 
 
 
374 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  33.5 
 
 
412 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  31.43 
 
 
425 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  34.3 
 
 
430 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 
384 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  36.81 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  35.58 
 
 
433 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
432 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 
425 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  30.65 
 
 
432 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  32.81 
 
 
426 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 
429 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  34.78 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  30 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  32.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  27.19 
 
 
412 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  32.14 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
432 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  31.72 
 
 
441 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  32.74 
 
 
415 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  30.36 
 
 
437 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  32.74 
 
 
415 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  36.98 
 
 
433 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  29.22 
 
 
432 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  31.59 
 
 
455 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  29.83 
 
 
437 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  37.04 
 
 
408 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  37.04 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  37.04 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  33.57 
 
 
404 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  32.37 
 
 
415 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  31.57 
 
 
428 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  31.85 
 
 
430 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  33.18 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.7 
 
 
411 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  32.7 
 
 
451 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  29.93 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  32.74 
 
 
418 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  29.45 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  30.82 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  33.1 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  26.64 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  30.73 
 
 
723 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
621 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>