More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2035 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  33.02 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.01 
 
 		 614 aa  103  6e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  28.48 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  31.41 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  31.41 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.85 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  38.38 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 		 433 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  30.41 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.27 
 
 		 826 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  36.87 
 
 		 1581 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  31.56 
 
 		 1049 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.08 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 		 1053 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  36.81 
 
 		 586 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 1818 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  28.44 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  28.44 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  29.9 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.31 
 
 		 751 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  39.31 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.2 
 
 		 742 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  33.94 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.35 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  28.44 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  37.08 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  31.05 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  36.99 
 
 		 829 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  27.43 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  36.42 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  37.67 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.22 
 
 		 1023 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  31.31 
 
 		 923 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  27.57 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  29.05 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.71 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  29.28 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.56 
 
 		 1044 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  28.22 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 		 1104 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  26.72 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  26.94 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  29.9 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  29.9 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  29.9 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  29.26 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1492 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  30.4 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 		 1007 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  26.02 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.41 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  28.34 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 		 1043 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  34.88 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1911 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.96 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.66 
 
 		 1041 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  28.43 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  38.51 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  33.72 
 
 		 781 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 		 618 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  26.07 
 
 		 1201 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  30.39 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  33.94 
 
 		 802 aa  76.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  27.38 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  31.46 
 
 		 1049 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  30.48 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>