More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1299 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  49.65 
 
 
1007 aa  884    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  55.98 
 
 
1183 aa  905    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  53.19 
 
 
1044 aa  858    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  49.14 
 
 
960 aa  771    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  55.1 
 
 
923 aa  927    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  46.54 
 
 
1186 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  40.82 
 
 
1064 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  56.84 
 
 
1049 aa  947    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  51.54 
 
 
1023 aa  942    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  43.81 
 
 
1201 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  55.03 
 
 
1041 aa  884    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.66 
 
 
1044 aa  781    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  48.72 
 
 
1049 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  45.49 
 
 
965 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  40.89 
 
 
1053 aa  712    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  100 
 
 
1492 aa  3105    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  53 
 
 
1581 aa  870    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  43.84 
 
 
1190 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  35.1 
 
 
1200 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  29.44 
 
 
644 aa  207  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  43.23 
 
 
775 aa  186  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.64 
 
 
1150 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.81 
 
 
1067 aa  109  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.06 
 
 
997 aa  108  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.41 
 
 
1148 aa  106  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.2 
 
 
887 aa  106  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.97 
 
 
1349 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23 
 
 
2216 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.82 
 
 
908 aa  105  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  23.11 
 
 
953 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  38.22 
 
 
251 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  34.68 
 
 
273 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.97 
 
 
888 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.46 
 
 
1339 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.9 
 
 
1091 aa  99.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  26.97 
 
 
1345 aa  99.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  98.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.52 
 
 
949 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
1818 aa  94.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.06 
 
 
783 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.19 
 
 
951 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  33.53 
 
 
444 aa  92.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.69 
 
 
2194 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.47 
 
 
751 aa  91.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.62 
 
 
1742 aa  91.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  35.5 
 
 
277 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 
469 aa  90.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  90.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.62 
 
 
1086 aa  90.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.95 
 
 
1216 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 
348 aa  89.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
842 aa  89.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.77 
 
 
762 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.77 
 
 
762 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.73 
 
 
433 aa  89.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.87 
 
 
1237 aa  89.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 
456 aa  89.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.4 
 
 
942 aa  89.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 
439 aa  89  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  23.82 
 
 
818 aa  88.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  29.21 
 
 
348 aa  87.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  33.53 
 
 
487 aa  87.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  22.13 
 
 
957 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.79 
 
 
951 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  39.71 
 
 
263 aa  86.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  29.55 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.31 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.89 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
861 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.59 
 
 
1004 aa  85.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 
377 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.37 
 
 
586 aa  85.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  27.34 
 
 
614 aa  84.3  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.2 
 
 
570 aa  84.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.59 
 
 
437 aa  83.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  28.87 
 
 
276 aa  83.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.46 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
620 aa  82.4  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
226 aa  82.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  26.1 
 
 
262 aa  82.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  33.93 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  28.1 
 
 
344 aa  82  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  34.52 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  34.57 
 
 
351 aa  81.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.94 
 
 
416 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  28.52 
 
 
338 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.77 
 
 
819 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
367 aa  80.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  33.15 
 
 
417 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
416 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  29.46 
 
 
265 aa  80.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.32 
 
 
267 aa  80.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  26.8 
 
 
1080 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
459 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
446 aa  80.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.53 
 
 
805 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.18 
 
 
468 aa  80.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  45 
 
 
304 aa  79.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  30.6 
 
 
299 aa  79.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>