More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2094 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
306 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  71.38 
 
 
291 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  69.57 
 
 
295 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  71.38 
 
 
291 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  71.38 
 
 
291 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  61.13 
 
 
325 aa  353  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  61.13 
 
 
324 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  56.81 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  57.48 
 
 
301 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  57 
 
 
319 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  59 
 
 
341 aa  328  9e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  53.97 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  60.47 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  54.97 
 
 
310 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  57.24 
 
 
307 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  56 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  56.19 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  55.15 
 
 
327 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  58.75 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  57.72 
 
 
299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  53.82 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  53.87 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  56.52 
 
 
317 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  53.31 
 
 
315 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  53.9 
 
 
294 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  51.61 
 
 
338 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  52.68 
 
 
308 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  51.67 
 
 
290 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  52.35 
 
 
311 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  51.67 
 
 
290 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  52 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  51.33 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  49.03 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  51.82 
 
 
337 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  49.83 
 
 
351 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  47.69 
 
 
329 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  52.67 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  49.66 
 
 
358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  45.71 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
367 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  48.66 
 
 
331 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  46.54 
 
 
408 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  49.04 
 
 
421 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  49.04 
 
 
377 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  47.32 
 
 
384 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  47.32 
 
 
390 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  46.37 
 
 
409 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50.49 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  45.39 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  45.77 
 
 
375 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  47.49 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  45.78 
 
 
318 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  47.83 
 
 
341 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  47.47 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.5 
 
 
312 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.51 
 
 
303 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
308 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  41.12 
 
 
361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  44.52 
 
 
309 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
319 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  42.24 
 
 
347 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  41.56 
 
 
349 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  41.91 
 
 
349 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  43.14 
 
 
319 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  41.58 
 
 
349 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  41.25 
 
 
349 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  41.25 
 
 
349 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.73 
 
 
301 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  41.38 
 
 
351 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  39.4 
 
 
352 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  39 
 
 
330 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  43.07 
 
 
259 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.28 
 
 
510 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.94 
 
 
751 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.66 
 
 
433 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.07 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.03 
 
 
390 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  35.32 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.91 
 
 
742 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31 
 
 
614 aa  110  3e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 
826 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.34 
 
 
348 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.41 
 
 
517 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 
517 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 
348 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.31 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  30.7 
 
 
369 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.71 
 
 
586 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  31.72 
 
 
338 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.77 
 
 
439 aa  99.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.01 
 
 
481 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.44 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  33.44 
 
 
444 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.44 
 
 
628 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  34.3 
 
 
437 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
861 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.28 
 
 
829 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>