More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1553 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  46.23 
 
 		 1186 aa  728    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  56 
 
 		 1183 aa  919    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  44.56 
 
 		 1201 aa  763    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  79.34 
 
 		 1041 aa  1342    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  46.43 
 
 		 1053 aa  920    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  50.35 
 
 		 960 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  54.93 
 
 		 923 aa  891    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.47 
 
 		 1044 aa  783    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  70.01 
 
 		 1044 aa  1172    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  65.78 
 
 		 1049 aa  1389    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  63.47 
 
 		 1007 aa  1266    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  46.07 
 
 		 1190 aa  687    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  46.74 
 
 		 1064 aa  869    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1023 aa  2111    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  50.37 
 
 		 1049 aa  961    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  45.65 
 
 		 965 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  51.59 
 
 		 1492 aa  944    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  52.19 
 
 		 1581 aa  877    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1200 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  48.35 
 
 		 775 aa  244  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  30.58 
 
 		 644 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  54.12 
 
 		 174 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.94 
 
 		 949 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.2 
 
 		 908 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.68 
 
 		 1148 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.8 
 
 		 1067 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.7 
 
 		 1237 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  32.16 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.14 
 
 		 997 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.54 
 
 		 951 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.33 
 
 		 953 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.23 
 
 		 1349 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  22.48 
 
 		 957 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.84 
 
 		 888 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.6 
 
 		 1086 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.26 
 
 		 762 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.26 
 
 		 762 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.92 
 
 		 887 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.67 
 
 		 951 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.83 
 
 		 766 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.24 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.56 
 
 		 1345 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.6 
 
 		 2216 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.5 
 
 		 614 aa  99.4  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.34 
 
 		 942 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.88 
 
 		 1339 aa  99.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  39.53 
 
 		 253 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 1818 aa  98.2  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 		 267 aa  96.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.81 
 
 		 805 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.86 
 
 		 1091 aa  95.9  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.11 
 
 		 783 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.99 
 
 		 2194 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  32.78 
 
 		 395 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1080 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.6 
 
 		 1742 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.88 
 
 		 725 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.72 
 
 		 416 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 416 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  32.16 
 
 		 766 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 		 273 aa  88.6  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.18 
 
 		 1004 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  22.86 
 
 		 1002 aa  88.2  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.88 
 
 		 412 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.32 
 
 		 751 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1196 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 517 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  35.67 
 
 		 263 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.47 
 
 		 798 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.04 
 
 		 1216 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.33 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.46 
 
 		 819 aa  85.5  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  28.62 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  32.04 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.47 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.23 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  25.38 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.51 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.79 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  27.22 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  32.43 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 		 417 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 		 654 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.79 
 
 		 348 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.62 
 
 		 439 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.66 
 
 		 293 aa  80.1  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.08 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  21.72 
 
 		 1267 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.88 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  23.79 
 
 		 781 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  25.32 
 
 		 1150 aa  79  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  35.06 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  28.73 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.87 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  30.11 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.6 
 
 		 801 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>