143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1048 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  100 
 
 		 1216 aa  2465    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.86 
 
 		 1148 aa  160  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.88 
 
 		 798 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.34 
 
 		 942 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.41 
 
 		 1004 aa  135  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.89 
 
 		 2216 aa  131  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  29.79 
 
 		 1002 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  32.71 
 
 		 1349 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  30.74 
 
 		 1237 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.33 
 
 		 951 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  33.21 
 
 		 2194 aa  115  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.01 
 
 		 1345 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  32.71 
 
 		 1339 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  29.41 
 
 		 783 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  31.95 
 
 		 1742 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.71 
 
 		 725 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  26.7 
 
 		 766 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  24.22 
 
 		 923 aa  98.6  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.52 
 
 		 1086 aa  98.2  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  27 
 
 		 1049 aa  98.2  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25.71 
 
 		 799 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.76 
 
 		 649 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.37 
 
 		 773 aa  95.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.35 
 
 		 908 aa  94.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.59 
 
 		 1150 aa  93.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  26.74 
 
 		 1049 aa  93.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.05 
 
 		 1044 aa  92  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.34 
 
 		 1041 aa  91.3  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 		 1067 aa  91.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1492 aa  90.1  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.84 
 
 		 1023 aa  89  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  23.99 
 
 		 1186 aa  88.6  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.38 
 
 		 805 aa  88.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  24.39 
 
 		 1064 aa  86.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.29 
 
 		 818 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1080 aa  85.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.79 
 
 		 570 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.95 
 
 		 888 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.84 
 
 		 1044 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.09 
 
 		 1190 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.36 
 
 		 1183 aa  83.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  23.31 
 
 		 1007 aa  81.6  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  26.04 
 
 		 960 aa  81.6  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  24.63 
 
 		 1053 aa  79  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1581 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.73 
 
 		 762 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.73 
 
 		 762 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  27.24 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.2 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1200 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  23.96 
 
 		 1201 aa  77  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.28 
 
 		 1330 aa  76.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1094 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.67 
 
 		 1091 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.04 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.2 
 
 		 958 aa  71.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.92 
 
 		 1267 aa  71.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.1 
 
 		 1174 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1181 aa  69.3  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.37 
 
 		 192 aa  68.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.49 
 
 		 1343 aa  68.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.16 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.76 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.65 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 		 232 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  23.04 
 
 		 1073 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.72 
 
 		 911 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.68 
 
 		 801 aa  62  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.73 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 593 aa  61.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.51 
 
 		 1438 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.59 
 
 		 951 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.64 
 
 		 431 aa  60.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.98 
 
 		 997 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.32 
 
 		 644 aa  60.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.73 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1818 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.9 
 
 		 944 aa  58.9  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.26 
 
 		 969 aa  59.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1224 aa  58.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.41 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.22 
 
 		 1475 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.14 
 
 		 180 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.89 
 
 		 1139 aa  57.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.61 
 
 		 157 aa  57  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.67 
 
 		 872 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.04 
 
 		 959 aa  56.2  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.75 
 
 		 492 aa  55.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  30.37 
 
 		 517 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  33.93 
 
 		 546 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32 
 
 		 886 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.26 
 
 		 642 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  25.09 
 
 		 1282 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2224  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 286 aa  52  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 522 aa  52  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  27.07 
 
 		 501 aa  51.6  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1636  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 		 296 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  36.36 
 
 		 1133 aa  51.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>