58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2638 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 
852 aa  1739    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.91 
 
 
944 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  37.06 
 
 
872 aa  321  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  37.8 
 
 
1475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.53 
 
 
1234 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.69 
 
 
1235 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.69 
 
 
1235 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.21 
 
 
1174 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.93 
 
 
725 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  25.41 
 
 
1150 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  22.38 
 
 
766 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.63 
 
 
762 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.63 
 
 
762 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.74 
 
 
1049 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.98 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.44 
 
 
773 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.43 
 
 
649 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25.45 
 
 
799 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.8 
 
 
1067 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.59 
 
 
805 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  26.67 
 
 
260 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  20.75 
 
 
1002 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.35 
 
 
949 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  25.37 
 
 
953 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.47 
 
 
1190 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.8 
 
 
1216 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.71 
 
 
1094 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.15 
 
 
942 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.85 
 
 
951 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25.46 
 
 
801 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.57 
 
 
1080 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.46 
 
 
1148 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.92 
 
 
1044 aa  57.4  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.32 
 
 
1492 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  24.18 
 
 
1053 aa  56.6  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.08 
 
 
1091 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  22.41 
 
 
923 aa  56.6  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.89 
 
 
951 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.64 
 
 
888 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.64 
 
 
908 aa  55.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  23.67 
 
 
1049 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.28 
 
 
951 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  22.25 
 
 
969 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  24.59 
 
 
1201 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  21.56 
 
 
1064 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.59 
 
 
911 aa  51.6  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.38 
 
 
1023 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  21.35 
 
 
960 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.4 
 
 
1004 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  23.94 
 
 
1335 aa  49.7  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.67 
 
 
2216 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.66 
 
 
1183 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.88 
 
 
1044 aa  48.5  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.03 
 
 
798 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  23.8 
 
 
783 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  20.56 
 
 
1186 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.31 
 
 
1041 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  23.15 
 
 
1237 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>