51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3348 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.65 
 
 
1148 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.13 
 
 
649 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.67 
 
 
1004 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.05 
 
 
1150 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.25 
 
 
798 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.46 
 
 
725 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.36 
 
 
1237 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.56 
 
 
951 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.67 
 
 
852 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.53 
 
 
942 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  21.94 
 
 
766 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.36 
 
 
773 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.62 
 
 
799 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.23 
 
 
783 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.26 
 
 
1080 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.61 
 
 
801 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  24.49 
 
 
1349 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.71 
 
 
805 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.26 
 
 
2216 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  25.39 
 
 
1190 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.27 
 
 
762 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.27 
 
 
762 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.77 
 
 
1339 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.48 
 
 
570 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  21.83 
 
 
1335 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.09 
 
 
944 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  25.61 
 
 
1492 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  22.09 
 
 
1186 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.27 
 
 
1742 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  22.13 
 
 
1345 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  23.36 
 
 
2194 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  24.69 
 
 
923 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.07 
 
 
1183 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  23.69 
 
 
1051 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  24.3 
 
 
960 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.38 
 
 
1049 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.52 
 
 
1267 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  29.05 
 
 
573 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.71 
 
 
1067 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  21.85 
 
 
1094 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  23.57 
 
 
1581 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.91 
 
 
1023 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  20.73 
 
 
818 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.6 
 
 
1044 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.62 
 
 
1868 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.15 
 
 
1807 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.77 
 
 
1174 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.23 
 
 
1475 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.46 
 
 
1235 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  24.12 
 
 
625 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>