105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1133 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 
951 aa  1936    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.28 
 
 
1343 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1587  TIR protein  62.83 
 
 
275 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0118312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  55.32 
 
 
1015 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  21.15 
 
 
1094 aa  94.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  34.59 
 
 
1085 aa  77.4  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.57 
 
 
1150 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.78 
 
 
805 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.85 
 
 
1148 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.24 
 
 
649 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.71 
 
 
510 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.2 
 
 
799 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.74 
 
 
762 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.74 
 
 
762 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.34 
 
 
951 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  31.36 
 
 
595 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.29 
 
 
997 aa  65.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.97 
 
 
766 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  22.92 
 
 
570 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.76 
 
 
908 aa  65.1  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0747  hypothetical protein  33.61 
 
 
428 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.509799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  35.45 
 
 
644 aa  64.7  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.73 
 
 
951 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.2 
 
 
1224 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.19 
 
 
1438 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.4 
 
 
783 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  26.67 
 
 
1065 aa  61.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  24.52 
 
 
493 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.23 
 
 
192 aa  60.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.12 
 
 
969 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  25.43 
 
 
1106 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.18 
 
 
1181 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.12 
 
 
1133 aa  60.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  24.32 
 
 
647 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.58 
 
 
872 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.85 
 
 
852 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.64 
 
 
725 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.2 
 
 
949 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.71 
 
 
838 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.27 
 
 
801 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.87 
 
 
1349 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.25 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.32 
 
 
958 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1074  signal transduction protein  26.67 
 
 
327 aa  56.6  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.801819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1849  hypothetical protein  23.12 
 
 
1459 aa  57  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.873254  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.5 
 
 
942 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  24.12 
 
 
1051 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.42 
 
 
490 aa  55.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.77 
 
 
1174 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
320 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 
399 aa  55.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.92 
 
 
1345 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.69 
 
 
953 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  21.98 
 
 
1199 aa  54.3  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.97 
 
 
1086 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.14 
 
 
1091 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  23.6 
 
 
1064 aa  53.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.06 
 
 
798 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.88 
 
 
1067 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.43 
 
 
911 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.04 
 
 
773 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  22.19 
 
 
1049 aa  52.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  25 
 
 
959 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.94 
 
 
1339 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  22.26 
 
 
319 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.21 
 
 
670 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1472  hypothetical protein  25.32 
 
 
821 aa  50.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.76 
 
 
1475 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.67 
 
 
887 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.87 
 
 
641 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.14 
 
 
1004 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.07 
 
 
323 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  23.08 
 
 
2194 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  32 
 
 
390 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  22.68 
 
 
546 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.1 
 
 
1237 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.14 
 
 
1742 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.2 
 
 
1216 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
593 aa  48.5  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  20.86 
 
 
1392 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1904  hypothetical protein  19.57 
 
 
772 aa  48.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.51395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  32.28 
 
 
1075 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
214 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.62 
 
 
221 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  21.07 
 
 
319 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  30 
 
 
818 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.18 
 
 
316 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  24.55 
 
 
625 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  25.22 
 
 
643 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.46 
 
 
888 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.23 
 
 
667 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.95 
 
 
1328 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  22.19 
 
 
1581 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.68 
 
 
1139 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.06 
 
 
1190 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.21 
 
 
208 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.84 
 
 
1044 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.29 
 
 
642 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.97 
 
 
157 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.45 
 
 
524 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>