235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0697 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.58 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.36 
 
 
173 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.37 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.8 
 
 
510 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.5 
 
 
399 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  44.67 
 
 
1148 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.8 
 
 
1343 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  39.41 
 
 
1094 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.9 
 
 
958 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  33.78 
 
 
546 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  45.22 
 
 
124 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.34 
 
 
395 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  39.75 
 
 
493 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.91 
 
 
490 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.85 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.83 
 
 
192 aa  82  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.79 
 
 
1412 aa  81.3  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.88 
 
 
831 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.88 
 
 
1224 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.56 
 
 
431 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  35.63 
 
 
321 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  33.33 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.34 
 
 
1438 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  38.62 
 
 
886 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  35.22 
 
 
959 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.26 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.24 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
1133 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.62 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.08 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.66 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.08 
 
 
501 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
593 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.1 
 
 
1181 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.61 
 
 
319 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.01 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.31 
 
 
1139 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.77 
 
 
1328 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.77 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.64 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.08 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.67 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.83 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  35.53 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.92 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.54 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  31.85 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  32.59 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  32.93 
 
 
838 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 
1234 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  29.82 
 
 
325 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.13 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 
641 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.03 
 
 
214 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 
313 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.37 
 
 
642 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.54 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.12 
 
 
320 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
320 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  33.08 
 
 
643 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 
646 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  35.77 
 
 
321 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.55 
 
 
321 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.71 
 
 
667 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.29 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.79 
 
 
666 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  33.11 
 
 
381 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.86 
 
 
121 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.11 
 
 
377 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  32.81 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.3 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.11 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1691  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.67 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  37.82 
 
 
1194 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  32.81 
 
 
249 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.48 
 
 
334 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.15 
 
 
101 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.72 
 
 
646 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 
670 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.08 
 
 
1041 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.85 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 
668 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.09 
 
 
333 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.58 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.58 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2402  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 
466 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.49 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  46.27 
 
 
321 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  37.21 
 
 
350 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>