35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0159 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 
350 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.74 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.45 
 
 
370 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  39.31 
 
 
321 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.68 
 
 
173 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.29 
 
 
200 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.34 
 
 
510 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.95 
 
 
214 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.59 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.21 
 
 
208 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  38.82 
 
 
501 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.58 
 
 
359 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  55.56 
 
 
524 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  33.03 
 
 
270 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.96 
 
 
493 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.43 
 
 
644 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.63 
 
 
958 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.38 
 
 
1438 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.86 
 
 
192 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  29.21 
 
 
164 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.21 
 
 
164 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.48 
 
 
1139 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.59 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  35 
 
 
101 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1691  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.56 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  26.9 
 
 
510 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  41.86 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.85 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  33.98 
 
 
646 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
157 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.72 
 
 
180 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.67 
 
 
490 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  29.41 
 
 
164 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>