18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0134 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  320  8e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  87.2 
 
 		 164 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  84.76 
 
 		 164 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2169  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  29.21 
 
 		 350 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.61 
 
 		 1181 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  31.43 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.39 
 
 		 1148 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.03 
 
 		 370 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.11 
 
 		 1343 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  35.11 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.4 
 
 		 1412 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.83 
 
 		 331 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 		 399 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 395 aa  41.2  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  35.94 
 
 		 321 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>