164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1531 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 1412 aa  2694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.25 
 
 		 958 aa  223  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.34 
 
 		 510 aa  205  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.1 
 
 		 1041 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1094 aa  188  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.66 
 
 		 959 aa  188  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.54 
 
 		 1139 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.09 
 
 		 1343 aa  155  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.76 
 
 		 395 aa  154  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.12 
 
 		 1438 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.53 
 
 		 524 aa  143  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1224 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.79 
 
 		 493 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.19 
 
 		 644 aa  125  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.98 
 
 		 1148 aa  124  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.47 
 
 		 1133 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.01 
 
 		 399 aa  110  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.05 
 
 		 431 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.9 
 
 		 490 aa  101  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.17 
 
 		 302 aa  100  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.01 
 
 		 390 aa  100  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1181 aa  97.8  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.78 
 
 		 546 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.52 
 
 		 1328 aa  90.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.32 
 
 		 192 aa  89.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.49 
 
 		 501 aa  89  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.59 
 
 		 1194 aa  88.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  34.45 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.79 
 
 		 208 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.36 
 
 		 831 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.78 
 
 		 670 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.33 
 
 		 517 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.05 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  29.57 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.52 
 
 		 408 aa  73.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.49 
 
 		 370 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.16 
 
 		 175 aa  74.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.67 
 
 		 334 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.27 
 
 		 321 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.5 
 
 		 178 aa  71.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.44 
 
 		 180 aa  70.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.21 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.6 
 
 		 666 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 593 aa  67.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.99 
 
 		 214 aa  68.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.82 
 
 		 176 aa  67  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.97 
 
 		 320 aa  67  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.34 
 
 		 886 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.25 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.66 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.09 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.3 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.96 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.12 
 
 		 646 aa  64.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.15 
 
 		 838 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.14 
 
 		 1110 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.97 
 
 		 251 aa  64.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  25.81 
 
 		 402 aa  63.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.75 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.5 
 
 		 157 aa  62.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 377 aa  60.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.72 
 
 		 319 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 320 aa  60.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.3 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.3 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.69 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  47.06 
 
 		 170 aa  59.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.72 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.3 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.3 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.3 
 
 		 335 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.45 
 
 		 320 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.1 
 
 		 428 aa  57.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  33.15 
 
 		 199 aa  57.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  29.07 
 
 		 773 aa  57.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.01 
 
 		 326 aa  57.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.56 
 
 		 375 aa  56.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  35.56 
 
 		 375 aa  56.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  35.56 
 
 		 375 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 		 515 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.56 
 
 		 375 aa  56.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.99 
 
 		 219 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.66 
 
 		 395 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.9 
 
 		 545 aa  55.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.39 
 
 		 331 aa  55.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.5 
 
 		 321 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.5 
 
 		 325 aa  55.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.57 
 
 		 557 aa  55.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.57 
 
 		 331 aa  55.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.51 
 
 		 395 aa  55.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.23 
 
 		 641 aa  54.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  29.81 
 
 		 515 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.03 
 
 		 323 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.11 
 
 		 150 aa  54.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 		 411 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.37 
 
 		 408 aa  55.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.39 
 
 		 375 aa  54.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  35.56 
 
 		 375 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>