261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2129 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
399 aa  756    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  42.86 
 
 
1094 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.83 
 
 
1343 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.22 
 
 
510 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.07 
 
 
395 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  37.83 
 
 
958 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  40.07 
 
 
1148 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  34.55 
 
 
1224 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.55 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.6 
 
 
251 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.07 
 
 
644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.96 
 
 
1438 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.82 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.54 
 
 
1412 aa  116  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  35.14 
 
 
546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  33.1 
 
 
1328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.21 
 
 
1181 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  34.54 
 
 
431 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.13 
 
 
390 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.29 
 
 
192 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.7 
 
 
524 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.17 
 
 
501 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.5 
 
 
208 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.32 
 
 
831 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.16 
 
 
323 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  32.98 
 
 
838 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.23 
 
 
302 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.86 
 
 
180 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  34.53 
 
 
959 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.94 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.25 
 
 
517 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  38.43 
 
 
299 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.99 
 
 
1139 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.9 
 
 
320 aa  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.98 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.02 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.49 
 
 
1133 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  37.6 
 
 
1194 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.58 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.44 
 
 
1041 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.22 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.77 
 
 
176 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.25 
 
 
1110 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.72 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.12 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.75 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.12 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.8 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.5 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
666 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  35.2 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.97 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  38.29 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.91 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  34.48 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.75 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  27.88 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  35.56 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.89 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.57 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  29.17 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.39 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.69 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  34.69 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.88 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  35.75 
 
 
886 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 
223 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.83 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.61 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.49 
 
 
641 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.97 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.88 
 
 
670 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.66 
 
 
215 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.77 
 
 
201 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.68 
 
 
175 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.38 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  31.98 
 
 
643 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  34.21 
 
 
756 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.48 
 
 
642 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.38 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.26 
 
 
642 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 
773 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.48 
 
 
223 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.47 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.27 
 
 
667 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.91 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.79 
 
 
208 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  29.82 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.65 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.8 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  33.91 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.44 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  39.47 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  32.12 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 
157 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.6 
 
 
646 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>