243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3019 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  100 
 
 		 546 aa  1102    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 		 1343 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.68 
 
 		 1148 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1094 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.58 
 
 		 1438 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.47 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.17 
 
 		 958 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1224 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1181 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.08 
 
 		 501 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.38 
 
 		 644 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.88 
 
 		 1139 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.15 
 
 		 395 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.39 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.17 
 
 		 319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.61 
 
 		 493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.14 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.27 
 
 		 319 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  29.28 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.76 
 
 		 390 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.92 
 
 		 886 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 593 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  27.17 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.12 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.58 
 
 		 959 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.31 
 
 		 320 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.25 
 
 		 667 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.9 
 
 		 320 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.27 
 
 		 1328 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.57 
 
 		 1412 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.78 
 
 		 208 aa  90.5  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  28.36 
 
 		 321 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30 
 
 		 323 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.21 
 
 		 670 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.78 
 
 		 313 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.47 
 
 		 321 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.04 
 
 		 192 aa  87  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.64 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  27.12 
 
 		 1133 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.16 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.91 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  27.92 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.34 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 		 302 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.15 
 
 		 646 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.39 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.94 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  32.35 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  28.76 
 
 		 1194 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  26.25 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  28.38 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.69 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.63 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.42 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.53 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.09 
 
 		 642 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.18 
 
 		 641 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.84 
 
 		 1041 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.77 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  30.37 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.69 
 
 		 157 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.6 
 
 		 223 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.02 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.16 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.51 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.69 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  26.68 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.02 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.26 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  29.72 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  29.26 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  24.14 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.21 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.5 
 
 		 823 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.73 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  25.83 
 
 		 325 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.24 
 
 		 199 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.97 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  27.18 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.62 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.18 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.93 
 
 		 176 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.51 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.78 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.23 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.23 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.26 
 
 		 831 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.14 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  27.74 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  26.46 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.14 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.31 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.15 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.4 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.35 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 		 223 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>