168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4600 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  90.57 
 
 		 221 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.4 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  36.46 
 
 		 1148 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.17 
 
 		 1343 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.71 
 
 		 395 aa  90.9  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.48 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  35.45 
 
 		 644 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  34.21 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  44 
 
 		 510 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.42 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.76 
 
 		 958 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1094 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.97 
 
 		 1139 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.91 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.52 
 
 		 493 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.58 
 
 		 667 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1224 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  47.73 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.06 
 
 		 370 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.89 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30.96 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.99 
 
 		 1412 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.73 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.13 
 
 		 831 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.36 
 
 		 1438 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.11 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.11 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.02 
 
 		 431 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.03 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  36.43 
 
 		 959 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 		 515 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  36.73 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  37.21 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.9 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  34.12 
 
 		 1133 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  38.1 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  45.95 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.04 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.54 
 
 		 1181 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.18 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.06 
 
 		 524 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.17 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.26 
 
 		 666 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.34 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.4 
 
 		 492 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.56 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 		 1041 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  28.42 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.9 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.94 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.3 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  36.67 
 
 		 374 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.61 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.79 
 
 		 886 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.29 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.61 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5007  hypothetical protein  35.16 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.37 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.11 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.59 
 
 		 321 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.05 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  30 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.4 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.07 
 
 		 445 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.92 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.36 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  28.72 
 
 		 381 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.65 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  36.03 
 
 		 428 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.9 
 
 		 101 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.18 
 
 		 641 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  37.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.45 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  29.21 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 670 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 		 408 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1901  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.04 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.08 
 
 		 642 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  29.85 
 
 		 756 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  35.54 
 
 		 838 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 415 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.79 
 
 		 320 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.81 
 
 		 642 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.67 
 
 		 951 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>