43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0072 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 442 aa  883    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  36.97 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.97 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.78 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.19 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.25 
 
 		 1343 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.8 
 
 		 1148 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1094 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.38 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.32 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.14 
 
 		 958 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1181 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.91 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1224 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.55 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.06 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.88 
 
 		 1139 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.22 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.44 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.38 
 
 		 323 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.51 
 
 		 1133 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.32 
 
 		 180 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.58 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.72 
 
 		 1438 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  26.03 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.99 
 
 		 232 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.71 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  31.1 
 
 		 1216 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.4 
 
 		 157 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  26.56 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  25 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.85 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  25.14 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  24.73 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.28 
 
 		 838 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  28 
 
 		 234 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  22.49 
 
 		 959 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.66 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.24 
 
 		 212 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.16 
 
 		 157 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.39 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>