270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1824 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  100 
 
 
1224 aa  2468    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  38.26 
 
 
1094 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.23 
 
 
1343 aa  304  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.89 
 
 
510 aa  226  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.41 
 
 
958 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.15 
 
 
490 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.75 
 
 
1438 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.92 
 
 
644 aa  160  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.42 
 
 
1139 aa  157  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.38 
 
 
1148 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.14 
 
 
1328 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.83 
 
 
493 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.17 
 
 
546 aa  145  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.78 
 
 
395 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.93 
 
 
501 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  25.97 
 
 
959 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.22 
 
 
1133 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.01 
 
 
524 aa  129  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.18 
 
 
1181 aa  126  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 
323 aa  118  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
1412 aa  118  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.55 
 
 
399 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.45 
 
 
390 aa  109  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 
838 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.69 
 
 
319 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.55 
 
 
251 aa  101  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.56 
 
 
666 aa  100  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.23 
 
 
319 aa  98.2  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.68 
 
 
320 aa  98.2  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.64 
 
 
670 aa  97.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.33 
 
 
667 aa  95.9  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.64 
 
 
192 aa  95.5  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  27.73 
 
 
323 aa  95.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.18 
 
 
370 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 
331 aa  93.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
313 aa  93.6  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  30.7 
 
 
321 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  33.67 
 
 
773 aa  92.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
176 aa  92.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.61 
 
 
1475 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  26.79 
 
 
886 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.77 
 
 
431 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.35 
 
 
320 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.25 
 
 
320 aa  89  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  29.11 
 
 
321 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 
642 aa  88.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  31.34 
 
 
325 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 
220 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.24 
 
 
180 aa  85.9  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.03 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.2 
 
 
408 aa  84.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.41 
 
 
333 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 
212 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.6 
 
 
200 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  28.71 
 
 
517 aa  83.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  25.4 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  26 
 
 
642 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  29.62 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.24 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  32.09 
 
 
402 aa  82  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.07 
 
 
321 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.64 
 
 
1194 aa  82  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  32.85 
 
 
522 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.3 
 
 
208 aa  79  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.32 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.47 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.69 
 
 
1110 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.66 
 
 
641 aa  77.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.44 
 
 
246 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.19 
 
 
331 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.89 
 
 
285 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.1 
 
 
157 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  34.18 
 
 
250 aa  76.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.22 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  30.05 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.82 
 
 
334 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 
223 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.88 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.5 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.91 
 
 
821 aa  71.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  24.63 
 
 
832 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.27 
 
 
643 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.72 
 
 
831 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  31.3 
 
 
321 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.43 
 
 
762 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.28 
 
 
173 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.43 
 
 
762 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  29.82 
 
 
361 aa  70.1  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.55 
 
 
319 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.55 
 
 
319 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.4 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.8 
 
 
232 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.49 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  30.49 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  29.11 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.37 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.53 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.55 
 
 
1041 aa  68.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>