158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0925 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1027    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.1 
 
 
958 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  35.71 
 
 
1094 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.06 
 
 
510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.41 
 
 
1343 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.76 
 
 
1148 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.76 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.14 
 
 
644 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.27 
 
 
323 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.15 
 
 
490 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.33 
 
 
524 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 
395 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.57 
 
 
501 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.88 
 
 
192 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.49 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
1181 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.13 
 
 
431 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.71 
 
 
1224 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.57 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.96 
 
 
1438 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.33 
 
 
1412 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.39 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.02 
 
 
959 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.56 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  27.27 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.52 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.62 
 
 
302 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.83 
 
 
1139 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.43 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.81 
 
 
666 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.27 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.73 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 
1110 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  26.61 
 
 
249 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.86 
 
 
232 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  26.61 
 
 
249 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.83 
 
 
1133 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  31.03 
 
 
1328 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.48 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  26.48 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.91 
 
 
223 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 
221 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  27.27 
 
 
886 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.22 
 
 
667 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  25.96 
 
 
250 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.41 
 
 
646 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0275  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.82 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.6 
 
 
1194 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  31.73 
 
 
773 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  25.69 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.25 
 
 
370 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.01 
 
 
269 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.75 
 
 
299 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.05 
 
 
408 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.71 
 
 
212 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.9 
 
 
214 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
593 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.65 
 
 
224 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 
220 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.95 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  24.73 
 
 
838 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.67 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 
831 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  27.95 
 
 
515 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.24 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.37 
 
 
1216 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  33.55 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.02 
 
 
905 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.59 
 
 
234 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.44 
 
 
220 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  29.24 
 
 
299 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  24.44 
 
 
254 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  26.25 
 
 
646 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
515 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.81 
 
 
557 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  28.5 
 
 
319 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  27.27 
 
 
321 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.12 
 
 
320 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 
320 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2060  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.05 
 
 
270 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.39 
 
 
821 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.18 
 
 
320 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.75 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  29.34 
 
 
199 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.77 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.51 
 
 
150 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  28.31 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.44 
 
 
208 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  25.11 
 
 
269 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.33 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.07 
 
 
822 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
545 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  26.21 
 
 
315 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.03 
 
 
442 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16601  hypothetical protein  27.66 
 
 
256 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.529095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5858  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.25 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.08 
 
 
334 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.74 
 
 
641 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.14 
 
 
197 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>