More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1736 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 1438 aa  2722    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.83 
 
 		 1148 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.61 
 
 		 1343 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1094 aa  320  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.04 
 
 		 958 aa  296  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.78 
 
 		 510 aa  254  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  39.96 
 
 		 1328 aa  251  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  36.55 
 
 		 546 aa  226  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.17 
 
 		 959 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1224 aa  221  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.94 
 
 		 644 aa  211  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37 
 
 		 1181 aa  192  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.19 
 
 		 490 aa  184  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.41 
 
 		 1412 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.81 
 
 		 1139 aa  181  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  34.22 
 
 		 838 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.12 
 
 		 395 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.55 
 
 		 493 aa  173  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.75 
 
 		 1110 aa  171  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.04 
 
 		 670 aa  165  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.2 
 
 		 524 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  37.27 
 
 		 1194 aa  158  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.39 
 
 		 666 aa  145  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.35 
 
 		 886 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.39 
 
 		 399 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.89 
 
 		 667 aa  138  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.3 
 
 		 1041 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  36.81 
 
 		 501 aa  136  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.74 
 
 		 390 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.55 
 
 		 642 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.56 
 
 		 320 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  26.86 
 
 		 1742 aa  134  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  27.37 
 
 		 1339 aa  132  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 		 646 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 		 641 aa  127  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.26 
 
 		 642 aa  124  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.45 
 
 		 643 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.84 
 
 		 1349 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  38.64 
 
 		 773 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.02 
 
 		 313 aa  122  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.79 
 
 		 1237 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.92 
 
 		 323 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  32.6 
 
 		 646 aa  119  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.69 
 
 		 2194 aa  118  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.77 
 
 		 1133 aa  118  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  40.52 
 
 		 319 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.65 
 
 		 192 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.04 
 
 		 325 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31 
 
 		 668 aa  115  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  38.36 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  40.51 
 
 		 323 aa  113  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.23 
 
 		 517 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.81 
 
 		 831 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.02 
 
 		 180 aa  108  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.49 
 
 		 334 aa  108  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.82 
 
 		 321 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.36 
 
 		 302 aa  106  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.44 
 
 		 320 aa  105  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45 
 
 		 251 aa  104  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  38.34 
 
 		 320 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.89 
 
 		 331 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  38.39 
 
 		 321 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.59 
 
 		 334 aa  102  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.49 
 
 		 370 aa  99.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.94 
 
 		 331 aa  99.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.67 
 
 		 1004 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  36.8 
 
 		 299 aa  99.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.3 
 
 		 232 aa  99.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.46 
 
 		 333 aa  98.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  37.29 
 
 		 321 aa  98.2  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1234 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  33.98 
 
 		 286 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.39 
 
 		 2216 aa  97.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  35.09 
 
 		 522 aa  97.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.94 
 
 		 951 aa  95.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  35.19 
 
 		 431 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.54 
 
 		 321 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.2 
 
 		 285 aa  94.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.93 
 
 		 331 aa  93.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 593 aa  92.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.31 
 
 		 1345 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  37.12 
 
 		 316 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  34.99 
 
 		 402 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  44.29 
 
 		 208 aa  90.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.51 
 
 		 319 aa  89  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.51 
 
 		 319 aa  89  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.2 
 
 		 408 aa  88.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  36.87 
 
 		 199 aa  88.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  30.84 
 
 		 361 aa  88.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.87 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.72 
 
 		 408 aa  87.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.45 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.2 
 
 		 157 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.61 
 
 		 395 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.42 
 
 		 725 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.69 
 
 		 1067 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.89 
 
 		 1475 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.61 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.46 
 
 		 400 aa  83.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.46 
 
 		 221 aa  83.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>