132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1940 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1044    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  50.25 
 
 
773 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  34.45 
 
 
1094 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.32 
 
 
1148 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.75 
 
 
1328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  42.68 
 
 
676 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.9 
 
 
1343 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
510 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 
1438 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.59 
 
 
838 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.85 
 
 
1224 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  42.74 
 
 
682 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.51 
 
 
1110 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.65 
 
 
958 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.22 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.57 
 
 
831 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.72 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.43 
 
 
959 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.69 
 
 
644 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.57 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.12 
 
 
1475 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.18 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.9 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 
1234 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
408 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 
448 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
593 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  33.57 
 
 
756 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.58 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.6 
 
 
302 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  27.81 
 
 
1133 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 
1181 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.19 
 
 
399 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.88 
 
 
192 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.8 
 
 
670 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.62 
 
 
501 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.86 
 
 
411 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.04 
 
 
157 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  41.51 
 
 
321 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
408 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  27.96 
 
 
969 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
208 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.39 
 
 
1139 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 
321 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.83 
 
 
1235 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.83 
 
 
1235 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  26.67 
 
 
428 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  35.76 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  37.67 
 
 
320 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 
1412 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.96 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  30 
 
 
1049 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  27.74 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.06 
 
 
667 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.41 
 
 
1041 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.99 
 
 
251 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.19 
 
 
824 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01700  26S proteasome regulatory subunit Rpn2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08480)  31.65 
 
 
1144 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0581702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  29.19 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.19 
 
 
1194 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  24.69 
 
 
564 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  24.69 
 
 
564 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  23.56 
 
 
944 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  24.69 
 
 
564 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.75 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.42 
 
 
907 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.17 
 
 
180 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  24.69 
 
 
564 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.12 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 
642 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.85 
 
 
203 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.2 
 
 
643 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.37 
 
 
323 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  37.24 
 
 
321 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.52 
 
 
821 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.03 
 
 
768 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  35.96 
 
 
646 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.37 
 
 
176 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.9 
 
 
1776 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.2 
 
 
646 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.68 
 
 
320 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.53 
 
 
319 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  26.7 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.67 
 
 
325 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0118  putative nuclease  35.71 
 
 
375 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  36.91 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 
200 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  25.08 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  24.52 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.79 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  35.48 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  35 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.24 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4498  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.44 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>