43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0995 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  60.2 
 
 
201 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  58.16 
 
 
208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.7 
 
 
219 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1897  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  36.18 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  30.96 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22361  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  28.04 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.08 
 
 
1148 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.14 
 
 
1328 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.09 
 
 
298 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
1343 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03871  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  22.91 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215926  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.22 
 
 
285 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1673  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  22.91 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  31.09 
 
 
315 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.45 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.72 
 
 
493 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  31.62 
 
 
286 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.21 
 
 
313 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.16 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.5 
 
 
1438 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 
399 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.63 
 
 
285 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.17 
 
 
958 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
287 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  30.36 
 
 
299 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  30.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
510 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.87 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  23.87 
 
 
644 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.05 
 
 
1094 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  33.72 
 
 
522 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 
831 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  28.47 
 
 
838 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.76 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.69 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.68 
 
 
180 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  28.89 
 
 
269 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.92 
 
 
1224 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  29.29 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  29.29 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>