37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03351 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  50.36 
 
 
315 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1901  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.1 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.23 
 
 
287 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  48.85 
 
 
287 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.71 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.29 
 
 
298 aa  201  8e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  40.94 
 
 
286 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  37.1 
 
 
299 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.25 
 
 
334 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.71 
 
 
285 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 
1181 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 
1343 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.52 
 
 
510 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.26 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.31 
 
 
546 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.62 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  38.1 
 
 
381 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.75 
 
 
1094 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 
201 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.63 
 
 
203 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.54 
 
 
1148 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.02 
 
 
1438 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.14 
 
 
493 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.12 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.49 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  34.09 
 
 
644 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1700  metalloenzyme domain-containing protein  30.83 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.973288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.63 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  28.42 
 
 
402 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
388 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25 
 
 
1224 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
375 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  27.69 
 
 
320 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>