41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0432 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  55 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  49.82 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1901  HEAT repeat-containing PBS lyase  50.52 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.71 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.71 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  40.71 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.08 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  36.2 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  37.69 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.04 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.75 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.57 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1094 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.15 
 
 		 958 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 		 1438 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1224 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 1343 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.48 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 1133 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1181 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  27.85 
 
 		 501 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.61 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.19 
 
 		 1328 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.53 
 
 		 121 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.25 
 
 		 644 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  33 
 
 		 838 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.2 
 
 		 1148 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.12 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  26.55 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  34.26 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.44 
 
 		 959 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 		 370 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.19 
 
 		 1412 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>