71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1901 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1901  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  53.93 
 
 
315 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  50.52 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.89 
 
 
298 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.1 
 
 
285 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  42.21 
 
 
299 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  41.41 
 
 
287 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.02 
 
 
287 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.09 
 
 
334 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  38.79 
 
 
286 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.14 
 
 
285 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.92 
 
 
1343 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.58 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.6 
 
 
1094 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.48 
 
 
1148 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.44 
 
 
958 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.85 
 
 
399 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.41 
 
 
395 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.89 
 
 
1438 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.96 
 
 
1412 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.67 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 
208 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.28 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 
1181 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.59 
 
 
644 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.16 
 
 
221 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.24 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.85 
 
 
493 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.98 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  31.35 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.16 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.73 
 
 
201 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.69 
 
 
546 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.81 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.06 
 
 
642 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.96 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.1 
 
 
1133 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 
831 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.94 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.64 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.81 
 
 
208 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.31 
 
 
1139 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  27.88 
 
 
431 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.96 
 
 
959 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 
377 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.79 
 
 
642 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.45 
 
 
1110 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.92 
 
 
1041 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  31.63 
 
 
250 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.54 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1700  metalloenzyme domain-containing protein  32.81 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.973288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.86 
 
 
490 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  27.8 
 
 
773 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.75 
 
 
192 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.09 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.58 
 
 
157 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  36.45 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 
641 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  30.73 
 
 
1058 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  31.29 
 
 
218 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.2 
 
 
524 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.72 
 
 
331 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.93 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.6 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07498  Deoxyhypusine hydroxylase (DOHH)(EC 1.14.99.29)(Deoxyhypusine monooxygenase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW32]  29.7 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
173 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.82 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.69 
 
 
1328 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.27 
 
 
101 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.36 
 
 
176 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>