75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2382 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  53.21 
 
 
219 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.71 
 
 
255 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  47.95 
 
 
222 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  47.2 
 
 
218 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  47.49 
 
 
221 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.81 
 
 
226 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 
223 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.92 
 
 
223 aa  131  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.38 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.38 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.92 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0166  hypothetical protein  35.1 
 
 
203 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0122  hypothetical protein  32.41 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.3 
 
 
220 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.9 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.96 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.67 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.67 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.67 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.25 
 
 
1148 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  26.7 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.11 
 
 
370 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  35.22 
 
 
546 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.22 
 
 
493 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.67 
 
 
666 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.37 
 
 
1094 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.23 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  27.23 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.19 
 
 
958 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 
1343 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.27 
 
 
1328 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.12 
 
 
1224 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.86 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.79 
 
 
333 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.27 
 
 
313 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.43 
 
 
399 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
319 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
319 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  27.54 
 
 
773 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  30.91 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.56 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.28 
 
 
667 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.41 
 
 
857 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.83 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.41 
 
 
857 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.63 
 
 
858 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.76 
 
 
400 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.14 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 
670 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.29 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  27.61 
 
 
315 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 
325 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.84 
 
 
285 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  26.4 
 
 
2216 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.01 
 
 
959 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.41 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  25 
 
 
522 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.78 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.47 
 
 
334 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  24.7 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.86 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.11 
 
 
510 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.76 
 
 
173 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.72 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  26.49 
 
 
319 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  27.32 
 
 
644 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  31.65 
 
 
250 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
835 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.08 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>